93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2128 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  100 
 
 		 263 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  35.86 
 
 		 264 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  35.17 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  33.77 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  30.56 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  33.64 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  28.63 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  35.46 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.89 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.86 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  31.72 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  32.89 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  27.95 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  27 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  28.38 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  33.57 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  35.51 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  35.66 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  27 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  34.81 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  27.43 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  32.88 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  33.33 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  31.14 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  34.97 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  32.65 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  31.97 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  32.65 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  31.33 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  27.43 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  33.33 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  32.21 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  31.97 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  31.41 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  32.65 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  30.34 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  35.2 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  32.5 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  27.06 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  29.32 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  32.41 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  28.18 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  34.65 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  31.03 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  29.17 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  28.57 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  28.86 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  31.01 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  27.81 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  33.81 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  29.55 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  21.92 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  23.21 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  25.63 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  33.09 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  25.69 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  32.21 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  27.83 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  26.24 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  27.52 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  28.7 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  30.14 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  31.71 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  26.03 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  31.3 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  33.15 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  26.48 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  25.76 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  36 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.33 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  30.99 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  20.45 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  28.21 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  35.56 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  31.51 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  27.48 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.36 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  26.45 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  31.52 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  27.36 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  28.71 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0508  DNA-binding protein  20.47 
 
 		 194 aa  42  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0116829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>