54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_p08220 on replicon NC_009777
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  26.77 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  29.65 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  30 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  27.83 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  27.51 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  27.83 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  25.11 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  32.98 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  24.42 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  25.34 
 
 		 251 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  26.11 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  31.78 
 
 		 135 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  37.1 
 
 		 301 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  26.11 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  24.68 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  25.27 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 115 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 115 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  22.34 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  32.29 
 
 		 132 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 132 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  28.72 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  27.43 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4206  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000156355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  33.33 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0691  hypothetical protein  26.38 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00140732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  23.83 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  23.92 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  29.9 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 128 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  25 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 115 aa  42  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0751  hypothetical protein  26.38 
 
 		 215 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  24.24 
 
 		 209 aa  42  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  21.23 
 
 		 243 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 133 aa  41.6  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  29.67 
 
 		 259 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 117 aa  41.6  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 130 aa  41.2  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  28.05 
 
 		 239 aa  41.2  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  23.08 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>