122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0641 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  100 
 
 		 263 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  28.71 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  28.71 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  34.48 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  33.79 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  37.14 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  29.32 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  32.66 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  35 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  30.94 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  34.71 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  33.17 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  38.21 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  38.21 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  27.18 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  35.43 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  29.65 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.08 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  30.51 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  33.86 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  28.57 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  42.71 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  34.96 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  27.65 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  27.17 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  34.96 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  33.06 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  33.33 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  37.1 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  32.54 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  32.54 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  33.33 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  33.01 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  27.31 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  32.23 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  26.64 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  33.97 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  33.71 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  33.6 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  32.12 
 
 		 237 aa  62  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  33.01 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  31.54 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  36.36 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  28.93 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  31.71 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  29.51 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  27.78 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  29.81 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  26.32 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.66 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  34.29 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  31.51 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  36.96 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  30.61 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  37.89 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  31.03 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  26.9 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  31.51 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  30.11 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  34.83 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  34.83 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  25.47 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  29.94 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  34.95 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  31.72 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  34.95 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  35.34 
 
 		 222 aa  53.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  29.32 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  28.98 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  30.58 
 
 		 233 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  35.97 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  30.53 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  30 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  37.5 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  34.58 
 
 		 144 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  41.89 
 
 		 209 aa  48.9  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  32.4 
 
 		 204 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  39.78 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  26.09 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  24.4 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  26.01 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  30.43 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  27.18 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  27.64 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  29.9 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4500  putative phage repressor  28.85 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  23.81 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  27.64 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  27.22 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  36.36 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>