244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0767 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  100 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  99.14 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  98.71 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  80.6 
 
 		 240 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  78.97 
 
 		 240 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  70.43 
 
 		 229 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  70.43 
 
 		 229 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  70.43 
 
 		 229 aa  351  5e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  64.13 
 
 		 225 aa  314  9e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  58.37 
 
 		 230 aa  287  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  56.9 
 
 		 263 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  55.93 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  49.15 
 
 		 237 aa  224  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  48.73 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  61.73 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  43.93 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  43.87 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  43.1 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  42.2 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  40 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  40.32 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  37.78 
 
 		 241 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  39.56 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  41.1 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  34.19 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  35.56 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  32.07 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  30.64 
 
 		 243 aa  121  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  34.65 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  33.62 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  31.62 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  35.44 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  31.28 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  32.03 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  30.17 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  31.66 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  51.39 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  51.39 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  47.89 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  47.89 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  28.15 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  26.34 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  53.62 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  27.85 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  55.38 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  55.38 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  28.8 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  51.43 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  33.68 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  26.79 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  30.13 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  32.33 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  27.07 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  26.97 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  36.64 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  26.92 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  27.83 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  25.11 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  31.97 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  31.97 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  31.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  26.44 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  28.78 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  28.08 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  50 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  27.94 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  26.67 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  42.03 
 
 		 71 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  30.83 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  26.86 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  27.11 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  26.18 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.71 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  28.47 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  26.4 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  26.4 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  26.61 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  27.14 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  26.84 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  24.79 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  29.01 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  28.87 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  26.71 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  25.83 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  26.84 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  25.89 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  24.09 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 71 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  0.0000852105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 359 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>