111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4115 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  47.83 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  38.33 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  42.75 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  31.96 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  30.6 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  30.6 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  30.17 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  29.58 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  28.38 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  28.51 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  30.08 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  30.08 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  28.17 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  30.47 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  30.04 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  28.3 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  29.55 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  27.43 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  27.49 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  26.69 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  28.45 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  23.74 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  29.21 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  28.23 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  28.51 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  35.61 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.56 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  30.04 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  27.14 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  28.57 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  25.51 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  26.46 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  25.84 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  34.23 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  24.32 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  27.92 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  25.22 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  28.02 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  25.23 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  23.48 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  25.81 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  34.31 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  27.03 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  27.27 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  25.51 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  26.58 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  26.69 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  32.12 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  28.05 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  31.17 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  24.88 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  24.79 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  30.17 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  25.58 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  30.37 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  34.09 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  27.59 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  27.23 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  27.08 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  25.11 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  28.06 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  33.63 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  25.79 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  26.28 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  32.62 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  27.52 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  25.54 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  27.52 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  30.15 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  31.21 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  23.42 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  30.95 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  29.71 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  30.56 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  27.61 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  32.61 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  25.35 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  23.36 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  23.24 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  37.84 
 
 		 109 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  24.28 
 
 		 204 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 141 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  28.74 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  27.01 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  26.28 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  30 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  27.16 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>