134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_52530 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  99.16 
 
 		 237 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  51.97 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  50.21 
 
 		 263 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  47.84 
 
 		 256 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  48.28 
 
 		 256 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  51.49 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  50.64 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  48.73 
 
 		 233 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  48.31 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  47.88 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  47.03 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  47.88 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  46.61 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  48 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  45.38 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 272 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  46.44 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  40.83 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  40.96 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  44.69 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  41.46 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  46.2 
 
 		 218 aa  158  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  43.81 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  34.89 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  32.77 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  31.25 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  33.2 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  38.78 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  29.49 
 
 		 209 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  31.78 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  31.74 
 
 		 205 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  29.96 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  29.87 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  26.89 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  45.88 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  30.7 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  30.67 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.66 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  27.53 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  26.96 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  30.09 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  27.8 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  28.09 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  26.07 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  26.25 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  27.78 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  28.21 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.43 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  33.12 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  26.07 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.76 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  29.28 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4890  XRE family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  33.33 
 
 		 292 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  28.02 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  31.73 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  27.88 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  28.89 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  24.26 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  24.26 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  24.79 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  26.18 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  28.99 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  26.16 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  30.16 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  24.69 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  26.43 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  25 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  38.36 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  26.55 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  26.56 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  32.74 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  26.1 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  27.15 
 
 		 265 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  28.33 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  27.23 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  26.91 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  24.79 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  24.41 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0593  transcriptional regulator, XRE family  24.68 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.71 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  25.71 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  25.71 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  34.43 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7538  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 139 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.0410709 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  33.96 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  30.66 
 
 		 193 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>