229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2481 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  62.68 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  39.21 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  38.39 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  36.61 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  45.99 
 
 		 210 aa  128  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  37.08 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  33.61 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  32.16 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  36.95 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  37.25 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  32.6 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  36.89 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  32.47 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  32.47 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  45.32 
 
 		 213 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  33.04 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  48.25 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  34.47 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  45 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  29.02 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  34.91 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  32.43 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  28.89 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  34.06 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  44.85 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  34.39 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  31.72 
 
 		 244 aa  85.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  34.39 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  33.33 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  31.02 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  30.49 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  29.36 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  27.07 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  30.92 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  29.22 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  29.44 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  28.7 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  31.97 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  29.44 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  28.26 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  32.57 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  27.6 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  28.7 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  28.26 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  26.79 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  27.88 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  28.7 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  28.84 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  34.78 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  32.37 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  32.24 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  27.27 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  29.82 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  26.96 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  31.31 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  30.14 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  25.85 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1678  putative phage repressor  34.22 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  27.83 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  29.49 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  27.39 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  27.71 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  26.47 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  28.09 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  26.52 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  27.09 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  27.9 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  29.06 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  27.05 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  32.41 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  24.49 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  24.43 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  28.26 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  35.82 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  24.66 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  34.91 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  32.87 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  32.33 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  29.6 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  33.33 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  25.2 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  27.49 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  26.89 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  27.78 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5381  prophage MuMc02, S24 family peptidase  51.02 
 
 		 51 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.381026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  32.46 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0962  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0340549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  34.45 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>