108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1096 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  100 
 
 		 219 aa  443  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  44.65 
 
 		 219 aa  208  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  33.65 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  29.58 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  31.88 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.44 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.23 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  38.76 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  28.87 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  26.96 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  26.79 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  36.09 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  34.85 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  30 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30.26 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  28.37 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  27.05 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  27.6 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  26.92 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  25.13 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  25.76 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  30.77 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  26.05 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  24.45 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  29.41 
 
 		 244 aa  62  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  34.71 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  27.59 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  32.92 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.08 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  30.08 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  28.36 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  22.87 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  29.53 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  25.93 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  25.74 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  33.72 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  27.89 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  37.5 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  26.67 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  23.98 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  30.17 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  26.8 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  33.6 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  29.07 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  32.58 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  32.53 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  37.97 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  30.23 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  28 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  24.23 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0804  hypothetical protein  40.58 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00564078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  20.85 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  29.55 
 
 		 263 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  25.71 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  26.2 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1440  signal peptidase I, putative  24.52 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  29.55 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  29.07 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  30.34 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  32.41 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  23.66 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  29.07 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  32.03 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  29.01 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  29.07 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  25.93 
 
 		 289 aa  48.9  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4076  putative phage repressor  31.11 
 
 		 108 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  30.23 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  25.93 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  24.17 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.41 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  25.27 
 
 		 289 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  33.33 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  26.98 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  31.54 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  23.65 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3696  peptidase S24, S26A and S26B  28.89 
 
 		 133 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.87177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  26.4 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  33.33 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  25.6 
 
 		 289 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  25.6 
 
 		 289 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  24.88 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  25.56 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  25.16 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  23.9 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  25.34 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  30.59 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  33.33 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  31.58 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  31.13 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  25 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  27.38 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  26.42 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  23.9 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>