62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0976 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  100 
 
 		 284 aa  588  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  28.99 
 
 		 235 aa  99  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  27.98 
 
 		 230 aa  92.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  25.71 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  24.17 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  24.38 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  27.34 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  30 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.65 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1427  CI repressor  35.21 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  23.41 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  32 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.65 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1615  hypothetical protein  31.82 
 
 		 174 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  29.09 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  23.46 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  24.41 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  34.21 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  24.7 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  32.1 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  24.46 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  31.63 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  30.93 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  30.63 
 
 		 193 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  23.58 
 
 		 247 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  43.04 
 
 		 222 aa  49.3  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  32.1 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  30.3 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  23.77 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  24.31 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04120  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 129 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  25.74 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  32.39 
 
 		 216 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  22.76 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  38.37 
 
 		 216 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  32.58 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  34.92 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  22.18 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  24.22 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  35.8 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  26.89 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  28.45 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  26.27 
 
 		 212 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  30.34 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  29.46 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  30.56 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  23.11 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  29.46 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  22.17 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  29.46 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  23.55 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  23.47 
 
 		 204 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  27.45 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  21.05 
 
 		 219 aa  42.7  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  28.71 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  26.16 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>