65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1643 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  100 
 
 		 289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  31.53 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  26.32 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  26.77 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  27.68 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  23.74 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  25.22 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  24.34 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  26.47 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  31.53 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  30.36 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  27.8 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.23 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  32.74 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  32.28 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  32.41 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  29.77 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  32.43 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  32.43 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  25.71 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  32.11 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  34.26 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  28.97 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  24.22 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  34.21 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  24.68 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  53.1  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  30.43 
 
 		 229 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  29.13 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  32.31 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  28.42 
 
 		 204 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  28.07 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  23.73 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  31.01 
 
 		 236 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  32.35 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  27.42 
 
 		 204 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  26.79 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  33.66 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  31.46 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  30.28 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  23.78 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  25.27 
 
 		 219 aa  46.2  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  23.05 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  22.1 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  26.04 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  27.18 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  27.78 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  30.43 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  25.17 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  27.78 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  29.85 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  27.78 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  26.72 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  28.72 
 
 		 144 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  28.41 
 
 		 205 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  28.7 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2378  bacteriophage CI repressor  38.6 
 
 		 209 aa  42.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00068987  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0066  hypothetical protein  32.11 
 
 		 135 aa  42.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00131878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>