114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3237 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  99.02 
 
 		 251 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  50.35 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  47.92 
 
 		 144 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  48.95 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  34.4 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  29.52 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  29.05 
 
 		 264 aa  78.2  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  28.71 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  32.27 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  27.23 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  28.35 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  27.08 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  35.04 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  25.13 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  31.46 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  26.06 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  28.5 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  27.98 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  34.56 
 
 		 234 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  31.28 
 
 		 264 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  27.78 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  28.38 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  25.43 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  31.2 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  25.84 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.1 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  29.32 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  29.32 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  27.4 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  29.14 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  29.59 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  29.74 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  29.59 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  35.29 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  33.83 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  25.13 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  28.43 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  29.91 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  26.47 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  28.93 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  28.93 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  27.84 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  36.72 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  28.76 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  31.62 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  25.28 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  31.63 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  33.33 
 
 		 269 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  28.65 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  28.08 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  30.39 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  31.37 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  26.91 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  27.01 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.14 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  26.91 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  30.43 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  24.72 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  25.63 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  24.12 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  28.42 
 
 		 289 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  26.64 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  32.58 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  28.72 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  23.3 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  26.62 
 
 		 273 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  33.68 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  24.4 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  32.98 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.09 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  33.7 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  24.28 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  30 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  26.24 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  25.32 
 
 		 259 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  34.65 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  26.97 
 
 		 229 aa  44.7  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  25.43 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  38.67 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  33.33 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  25.49 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  27.36 
 
 		 263 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  34.38 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  31.51 
 
 		 263 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1678  putative phage repressor  29.23 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0803  hypothetical protein  30.11 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  44.19 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  30.7 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  27.36 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>