More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2974 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  100 
 
 
208 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  69.92 
 
 
202 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  59.4 
 
 
150 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  58.54 
 
 
238 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  52.98 
 
 
153 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  55.65 
 
 
138 aa  154  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  55.65 
 
 
138 aa  154  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  53.66 
 
 
139 aa  153  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  56.91 
 
 
132 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  51.54 
 
 
168 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  51.54 
 
 
168 aa  151  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  51.54 
 
 
168 aa  151  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  53.49 
 
 
186 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  54.92 
 
 
243 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  51.22 
 
 
150 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  44.44 
 
 
164 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  52.85 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  51.22 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  49.32 
 
 
148 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  56.3 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  52.46 
 
 
147 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40.58 
 
 
144 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  40.58 
 
 
144 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  54.1 
 
 
143 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  47.15 
 
 
150 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  47.58 
 
 
153 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  45.04 
 
 
139 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  45.04 
 
 
139 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  45.04 
 
 
139 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  45.04 
 
 
139 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  43.9 
 
 
150 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  47.15 
 
 
150 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  55.08 
 
 
143 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  55.93 
 
 
143 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  43.22 
 
 
149 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  48.76 
 
 
145 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  45.16 
 
 
141 aa  125  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  45.9 
 
 
138 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  53.39 
 
 
143 aa  124  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  45.08 
 
 
138 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  52.76 
 
 
142 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  44.6 
 
 
151 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  44.26 
 
 
143 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  45.08 
 
 
138 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  51.28 
 
 
137 aa  121  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  43.38 
 
 
148 aa  121  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  47.15 
 
 
149 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  47.93 
 
 
144 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  42.96 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  43.9 
 
 
146 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  45.45 
 
 
139 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  44.63 
 
 
139 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  44.63 
 
 
139 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  44.63 
 
 
139 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  44.63 
 
 
139 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  44.53 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  44.63 
 
 
139 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  44.63 
 
 
139 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  44.63 
 
 
139 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  44.63 
 
 
139 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  48.39 
 
 
147 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  40.8 
 
 
142 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  48.09 
 
 
145 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  46.15 
 
 
154 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  46.22 
 
 
145 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  45.16 
 
 
139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  45.16 
 
 
139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  45.16 
 
 
139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  49.12 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  45.3 
 
 
151 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  44.63 
 
 
139 aa  107  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  47.01 
 
 
151 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  47.46 
 
 
139 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  43.85 
 
 
141 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  45.16 
 
 
142 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  41.04 
 
 
142 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  42.74 
 
 
151 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  41.03 
 
 
171 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.2 
 
 
140 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.03 
 
 
150 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  39.17 
 
 
143 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1781  putative prophage repressor  36.51 
 
 
194 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000051926  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1981  LexA repressor  41.32 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0274768 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1832  transcriptional repressor, LexA family  39.17 
 
 
207 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  40.68 
 
 
171 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7045  peptidase S24 and S26 domain protein  43.59 
 
 
151 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1096  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.97 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0403674  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  36.07 
 
 
202 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1543  transcriptional repressor, LexA family  35.5 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1868  LexA repressor  35.5 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0099  LexA repressor  40.34 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  36.44 
 
 
202 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  38.33 
 
 
216 aa  88.2  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  36.44 
 
 
202 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6846  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  37.01 
 
 
178 aa  88.2  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.391579  normal  0.145831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1683  LexA repressor  36.44 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141699  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  39.32 
 
 
158 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  39.32 
 
 
137 aa  86.3  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  36.44 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0085  LexA repressor  39.5 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>