More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3076 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  54.84 
 
 		 238 aa  161  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  55.2 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  51.03 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  56.8 
 
 		 212 aa  155  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  56 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.2 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  53.66 
 
 		 208 aa  153  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  55.65 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  52.46 
 
 		 202 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  53.66 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  52.8 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  52.8 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  51.22 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  53.66 
 
 		 243 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  51.11 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  51.22 
 
 		 143 aa  141  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  47.97 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  51.64 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  51.61 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  47.45 
 
 		 138 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  51.22 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  51.59 
 
 		 142 aa  135  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  51.22 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  46.77 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  46.77 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  46.77 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  46.72 
 
 		 138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  48.39 
 
 		 206 aa  131  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  47.58 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  46.77 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  48.31 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  48.31 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  49.57 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  50.41 
 
 		 139 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.2 
 
 		 139 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  44.2 
 
 		 139 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  47.97 
 
 		 148 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  50 
 
 		 142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  43.48 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  43.48 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  47.11 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  47.11 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  47.11 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  44.35 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  48.39 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  47.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  47.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  47.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  48.39 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  46.72 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  44.35 
 
 		 164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  44.26 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  43.18 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  42.42 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  43.55 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  47.01 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  46.61 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  43.94 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  41.61 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  39.13 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  44.35 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  48 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  44.09 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  39.02 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.8 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  39.02 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.02 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  42.74 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  39.52 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  39.86 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  36.59 
 
 		 171 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  35.77 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.21 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  39.02 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  40.16 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  42.74 
 
 		 202 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  40.94 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  38.52 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4982  SOS mutagenesis protein UmuD  36.43 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865075  unclonable  0.00000215009 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  37.8 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.14 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  42.5 
 
 		 204 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  37.01 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  40.91 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.91 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  40.91 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  40.91 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  40.91 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  40.91 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  40.91 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  40.91 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  40.91 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.59 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>