More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3840 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  100 
 
 		 143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  85.31 
 
 		 143 aa  256  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  82.52 
 
 		 143 aa  248  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  70.16 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  53.54 
 
 		 186 aa  148  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  54.31 
 
 		 243 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  52.54 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  51.28 
 
 		 206 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  44.78 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  50.85 
 
 		 238 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  53.39 
 
 		 208 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  49.14 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  47.41 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  50 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  50.86 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  49.14 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  52.68 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  46.46 
 
 		 144 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  46.46 
 
 		 144 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  48.28 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  50 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  50.86 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.4 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  42.42 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  48.06 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  45.76 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  45.76 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  45.76 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  48.28 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  49.57 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  46.61 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  50.91 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  50.86 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  41.88 
 
 		 149 aa  110  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  38.13 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  46.36 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  40.85 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  42.48 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  38.84 
 
 		 212 aa  103  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  34.03 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  47.01 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  43.22 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  47.41 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  39.66 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  42.37 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  40.74 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  39.2 
 
 		 151 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  46.43 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  45.16 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  45.16 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  45.16 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  45.16 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  44.35 
 
 		 145 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  40 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  42.86 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  39.84 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  39.17 
 
 		 171 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  46.36 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  46.36 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  46.36 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  46.36 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  46.36 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  46.36 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  43.44 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  46.36 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  46.36 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  46.36 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  45.76 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  45.76 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  45.76 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  40.35 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.64 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  40.91 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  41.07 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  38.14 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.8 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  43.75 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  41.82 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  36.52 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  46 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  40 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  39.29 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7045  peptidase S24 and S26 domain protein  40.83 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  43.24 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4982  SOS mutagenesis protein UmuD  38.26 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865075  unclonable  0.00000215009 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0755  SOS-response transcriptional repressor  46.51 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0735  peptidase S24, S26A and S26B  36.69 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6846  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  41.41 
 
 		 178 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.391579  normal  0.145831 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0002  ultraviolet light resistance protein A  33.33 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1424  peptidase S24, S26A and S26B  35.25 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  38.98 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  36.09 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2082  LexA repressor  40.18 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.09 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 245 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  37.84 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1096  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.38 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0403674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.74 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>