282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1336 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  100 
 
 
145 aa  286  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  50.41 
 
 
202 aa  120  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  41.22 
 
 
144 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  41.22 
 
 
144 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  45.83 
 
 
238 aa  120  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  46.67 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  45.3 
 
 
186 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40.28 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40.52 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40.52 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.97 
 
 
143 aa  113  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  37.8 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  46.67 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  45.38 
 
 
243 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  39.66 
 
 
138 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  46.22 
 
 
208 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  45.83 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  46.15 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  43.8 
 
 
153 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.24 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  39.17 
 
 
168 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  39.17 
 
 
168 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  39.17 
 
 
168 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  41.91 
 
 
148 aa  102  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  38.79 
 
 
138 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  38.79 
 
 
138 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  38.13 
 
 
146 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  37.6 
 
 
150 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  36.75 
 
 
206 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  42.98 
 
 
158 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  37.39 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  41.03 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  40.32 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  36.52 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  37.39 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  38.35 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  43.1 
 
 
145 aa  93.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  37.8 
 
 
212 aa  92.8  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  38.66 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  37.5 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  37.39 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  31.62 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  37.61 
 
 
139 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.61 
 
 
139 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  37.07 
 
 
163 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  37.61 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  37.61 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.93 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  39.84 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  41.74 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  36.52 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  32.84 
 
 
142 aa  87.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  33.62 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  37.72 
 
 
171 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  40.65 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  37.88 
 
 
141 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  35.65 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  34.78 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  34.78 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  34.78 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  34.78 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  34.78 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  34.78 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  34.78 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  34.78 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  38.6 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  34.78 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  36.52 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  32.8 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  38.26 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4982  SOS mutagenesis protein UmuD  36.36 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865075  unclonable  0.00000215009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  38.26 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  38.26 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.39 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  38.26 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  37.4 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  33.63 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  34.78 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.25 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  38.39 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  33.33 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  31.82 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.68 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2467  DNA polymerase V subunit  36.44 
 
 
223 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.000992934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.91 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10663  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediatedautopeptidase)-like protein  31.3 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0755  SOS-response transcriptional repressor  35.42 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  33.33 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  32.43 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7045  peptidase S24 and S26 domain protein  39.47 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3537  hypothetical protein  33.91 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  34.55 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  32.73 
 
 
141 aa  67  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2195  putative prophage repressor  34.55 
 
 
274 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.543722  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1782  putative prophage repressor  34.55 
 
 
274 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  33.04 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1833  putative prophage repressor  33.64 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.04 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  31.4 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>