282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4997 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  100 
 
 		 171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  83.87 
 
 		 171 aa  261  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  89.86 
 
 		 151 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7045  peptidase S24 and S26 domain protein  93.48 
 
 		 151 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  58.7 
 
 		 151 aa  167  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  56.52 
 
 		 151 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  55.07 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  55.07 
 
 		 150 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  43.86 
 
 		 144 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.86 
 
 		 144 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  45.08 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.04 
 
 		 143 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  44.54 
 
 		 202 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  38.84 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.02 
 
 		 138 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.34 
 
 		 132 aa  107  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.54 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.02 
 
 		 138 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  44.07 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.33 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  37.31 
 
 		 150 aa  100  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  41.18 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.7 
 
 		 143 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.33 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  40.68 
 
 		 208 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.73 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  35.83 
 
 		 139 aa  96.3  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  36.43 
 
 		 243 aa  96.3  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  38.02 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  38.02 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  38.02 
 
 		 168 aa  94.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  43.33 
 
 		 147 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  43.64 
 
 		 143 aa  94.4  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  36.07 
 
 		 150 aa  94.4  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  35.29 
 
 		 138 aa  94.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  35.29 
 
 		 138 aa  94.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  34.92 
 
 		 149 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  36.43 
 
 		 150 aa  92.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  36.43 
 
 		 206 aa  92  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  39.29 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  40.83 
 
 		 148 aa  91.3  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  39.55 
 
 		 238 aa  91.3  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  38.89 
 
 		 144 aa  90.9  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  39.29 
 
 		 143 aa  90.5  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  42.48 
 
 		 137 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  38.58 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  38.39 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  37.5 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  36.43 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  38.02 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.5 
 
 		 139 aa  84.7  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  37.5 
 
 		 139 aa  84.7  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  38.39 
 
 		 145 aa  84.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  37.5 
 
 		 139 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  37.82 
 
 		 139 aa  84.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  37.5 
 
 		 139 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3519  hypothetical protein  61.67 
 
 		 66 aa  84  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  35.04 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  40 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  32.28 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  37.5 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  35.16 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  42.73 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  32.28 
 
 		 141 aa  80.5  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  30.71 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0002  ultraviolet light resistance protein A  36.44 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  36.07 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  41.05 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  33.88 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  33.59 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  42.16 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  34.23 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  37.63 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  36.56 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  36.56 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  33.06 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  36.56 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  36.56 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  36.56 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  36.56 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  36.56 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  36.56 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  33.06 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  33.06 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1981  SOS-response transcriptional repressors (RecA- mediated autopeptidase)-like protein  46.97 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125768  normal  0.0169516 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4982  SOS mutagenesis protein UmuD  32.76 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865075  unclonable  0.00000215009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.87 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  31.4 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.67 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  33.05 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0755  SOS-response transcriptional repressor  38.82 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  41.03 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0735  peptidase S24, S26A and S26B  30.4 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1424  peptidase S24, S26A and S26B  30.4 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.84 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.66 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6846  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  38 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.391579  normal  0.145831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  31.93 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  28.33 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1781  putative prophage repressor  30.58 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000051926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>