More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2465 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  99.28 
 
 
139 aa  279  8.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  80.29 
 
 
139 aa  231  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  72.46 
 
 
139 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  72.46 
 
 
139 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  72.46 
 
 
139 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  58.65 
 
 
144 aa  176  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  60.98 
 
 
139 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  60.98 
 
 
139 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  60.98 
 
 
139 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  60.98 
 
 
139 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  54.07 
 
 
142 aa  153  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  55.65 
 
 
148 aa  149  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  50.36 
 
 
140 aa  143  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  52.52 
 
 
243 aa  143  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  50 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  50.77 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  48.57 
 
 
145 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  47.69 
 
 
138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  47.69 
 
 
138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  48.44 
 
 
202 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  49.19 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  44.78 
 
 
212 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  47.79 
 
 
206 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  46.92 
 
 
150 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  46.51 
 
 
168 aa  123  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  46.21 
 
 
238 aa  123  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  47.11 
 
 
139 aa  123  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  47.2 
 
 
168 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  44.62 
 
 
150 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  47.52 
 
 
142 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  46.4 
 
 
168 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  49.59 
 
 
146 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  46.04 
 
 
141 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  51.28 
 
 
132 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  44.68 
 
 
143 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  40.3 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  47.11 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  44.78 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  46.15 
 
 
137 aa  117  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.08 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  45.31 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  44.72 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.9 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  44.72 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  40.94 
 
 
149 aa  114  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  44.63 
 
 
208 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  39.52 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  42.31 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  42.4 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  38.41 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  41.54 
 
 
147 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  45.53 
 
 
164 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  42.74 
 
 
148 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  41.48 
 
 
153 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  35.71 
 
 
141 aa  101  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  36.05 
 
 
151 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  47.79 
 
 
143 aa  100  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  41.73 
 
 
143 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  47.37 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  46.34 
 
 
158 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  42.61 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  43.48 
 
 
137 aa  97.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  40.32 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  39.5 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  39.5 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  38.93 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  45.83 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.72 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2469  putative prophage repressor  42.75 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.244846  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1055  DNA polymerase V subunit  38.14 
 
 
128 aa  94.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158623  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  40.87 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  40 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2467  DNA polymerase V subunit  40.34 
 
 
223 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.000992934 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.36 
 
 
144 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  42.61 
 
 
135 aa  93.6  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  38.28 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.28 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  45.45 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  46.36 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  40.87 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  42.74 
 
 
142 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  39.13 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.13 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  41.13 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.13 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  41.96 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.8 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  39.13 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1782  putative prophage repressor  41.44 
 
 
274 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2195  putative prophage repressor  40.54 
 
 
274 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.543722  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1424  peptidase S24, S26A and S26B  42.15 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.13 
 
 
135 aa  84.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>