More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1368 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  71.33 
 
 		 150 aa  234  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  68.24 
 
 		 150 aa  212  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  65.54 
 
 		 212 aa  206  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  65.54 
 
 		 150 aa  206  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  54.79 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  55.2 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  52.55 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  50.81 
 
 		 238 aa  145  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  50.36 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  48.89 
 
 		 186 aa  143  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  51.2 
 
 		 168 aa  138  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  51.2 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  52.03 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  52.03 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  50.4 
 
 		 168 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  45.6 
 
 		 202 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.41 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  46.09 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  45.59 
 
 		 243 aa  131  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  46.34 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  46.4 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  45.31 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  43.9 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  42.55 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  46.72 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  45.31 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  48.44 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  41.6 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  48.44 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  48.44 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  48.44 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  48.78 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  46.83 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  44.8 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  47.66 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  52.14 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  52.14 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  45.16 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  44.62 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  44.62 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  44.62 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  44.62 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  44.62 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  44.62 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  44.62 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  44.62 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  44.62 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  47.24 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  40.6 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  40.6 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  40.6 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  40.29 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  43.65 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  40.6 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  43.59 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  45.16 
 
 		 164 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  44 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  45.6 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  42.4 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  42.4 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  48.74 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  38.13 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  42.86 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  39.83 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  38.24 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  38.78 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  44.07 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  38.64 
 
 		 151 aa  104  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  35.97 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.69 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  45.16 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  37.23 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.94 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  39.69 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.6 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  37.39 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7045  peptidase S24 and S26 domain protein  38.24 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  40.62 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  43.33 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  37.31 
 
 		 171 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  41.13 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.77 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.74 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  37.7 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  39.52 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  39.5 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  37.01 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  42.02 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  36.59 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  39.5 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  35.2 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  37.27 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  40.34 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  40.34 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10663  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediatedautopeptidase)-like protein  39.17 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1635  umuD protein  43.44 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  39.37 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  39.37 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>