More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1032 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  100 
 
 
150 aa  309  9e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  68 
 
 
150 aa  213  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  66 
 
 
150 aa  210  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  66.67 
 
 
212 aa  210  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  65.54 
 
 
150 aa  206  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  52.05 
 
 
149 aa  166  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  54.29 
 
 
141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  55.65 
 
 
139 aa  152  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  49.29 
 
 
142 aa  150  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  50.75 
 
 
238 aa  150  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  50 
 
 
206 aa  138  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  44.06 
 
 
186 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  50.79 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  41.5 
 
 
168 aa  130  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  45.24 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  47.15 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  47.15 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  47.15 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  45.97 
 
 
168 aa  127  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  40.82 
 
 
168 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  45.8 
 
 
202 aa  127  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  46.51 
 
 
243 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  49.57 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.31 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  45.74 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  46.22 
 
 
139 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  46.22 
 
 
139 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  46.22 
 
 
139 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  46.22 
 
 
139 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  41.73 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  43.61 
 
 
148 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.31 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  41.48 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  41.48 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  41.48 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  43.41 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  42.31 
 
 
144 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  42.11 
 
 
138 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  42.31 
 
 
144 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  41.86 
 
 
138 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  41.86 
 
 
138 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  41.01 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.09 
 
 
143 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  38.41 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  38.41 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  38.41 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  38.41 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  38.41 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  38.41 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  38.41 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  38.41 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  38.41 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  40.88 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  42.74 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  43.59 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  42.31 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  44.54 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  44.72 
 
 
139 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  42.06 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  40.65 
 
 
151 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.31 
 
 
149 aa  104  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  38.71 
 
 
164 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  40.16 
 
 
143 aa  103  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  41.74 
 
 
137 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  43.59 
 
 
145 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  39.66 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  42.06 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  38.79 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  37.39 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  40.68 
 
 
142 aa  93.6  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  36.89 
 
 
143 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.23 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  36.03 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  39.66 
 
 
146 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  33.07 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  40 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10663  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediatedautopeptidase)-like protein  39.84 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  36.3 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  32.59 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  32.59 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.16 
 
 
150 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  40.34 
 
 
819 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  32.28 
 
 
141 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.65 
 
 
151 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  33.07 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  32.28 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6846  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  33.59 
 
 
178 aa  80.1  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.391579  normal  0.145831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.22 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.21 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  32.52 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.65 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  34.65 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.45 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  34.65 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  32.28 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7045  peptidase S24 and S26 domain protein  33.33 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.28 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  34.15 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  34.17 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  32.28 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>