More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0704 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  100 
 
 
163 aa  340  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  61.86 
 
 
153 aa  154  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  48.59 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  51.47 
 
 
139 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  51.47 
 
 
139 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  51.47 
 
 
139 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  51.47 
 
 
139 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  51.52 
 
 
144 aa  134  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  46.62 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  49.18 
 
 
243 aa  127  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  42.38 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  43.06 
 
 
164 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  41.72 
 
 
168 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  46.83 
 
 
150 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  41.72 
 
 
168 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  44.72 
 
 
146 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  42.14 
 
 
143 aa  123  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.85 
 
 
143 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40.56 
 
 
147 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  44.35 
 
 
139 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.4 
 
 
132 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  45.74 
 
 
238 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  49.18 
 
 
148 aa  121  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.31 
 
 
138 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  43.31 
 
 
138 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  47.11 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  47.11 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.31 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  47.11 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  47.5 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  45.83 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  47.11 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  46.97 
 
 
150 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  49.15 
 
 
148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  47.86 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  49.18 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  44.53 
 
 
208 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  45.97 
 
 
212 aa  114  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  45.16 
 
 
139 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  41.86 
 
 
143 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  49.55 
 
 
143 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  45.6 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  42.31 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  40.56 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  45.11 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  48.21 
 
 
149 aa  111  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  41.8 
 
 
138 aa  111  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  41.8 
 
 
138 aa  111  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  44.8 
 
 
150 aa  111  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  43.65 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  43.65 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  43.65 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  42.31 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  44.19 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  43.59 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  40.65 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  46.36 
 
 
143 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40.62 
 
 
158 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  43.41 
 
 
141 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  43.59 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  45.54 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.59 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  44.96 
 
 
145 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  39.68 
 
 
142 aa  107  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  42.19 
 
 
142 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.31 
 
 
152 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  42.4 
 
 
140 aa  104  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  42.52 
 
 
158 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.76 
 
 
153 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  41.53 
 
 
149 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  41.6 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  42.19 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  43.09 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  40.17 
 
 
141 aa  95.5  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  41.53 
 
 
171 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  41.88 
 
 
201 aa  94.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0735  peptidase S24, S26A and S26B  40 
 
 
144 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1424  peptidase S24, S26A and S26B  40 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  38.89 
 
 
151 aa  94  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  45.69 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.53 
 
 
196 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  49.45 
 
 
202 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.3 
 
 
201 aa  90.9  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.67 
 
 
207 aa  90.5  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  37.07 
 
 
145 aa  90.5  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.62 
 
 
231 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1866  LexA repressor  40.5 
 
 
225 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  43.28 
 
 
197 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  41.53 
 
 
203 aa  88.6  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4982  SOS mutagenesis protein UmuD  32.59 
 
 
146 aa  88.6  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865075  unclonable  0.00000215009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.37 
 
 
213 aa  87.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  40.5 
 
 
819 aa  87.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.34 
 
 
229 aa  87.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  39.34 
 
 
230 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.88 
 
 
204 aa  87  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>