More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3074 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  100 
 
 		 197 aa  387  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  45.23 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  40.53 
 
 		 227 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  39.08 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  36 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  40.89 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  40.09 
 
 		 231 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  40.38 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  39.74 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  39.5 
 
 		 237 aa  138  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  38.17 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  39.42 
 
 		 240 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  40.61 
 
 		 228 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  39.24 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  39.58 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  44.06 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  37.34 
 
 		 240 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  37.34 
 
 		 240 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  38.93 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  38.33 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  37.93 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.64 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  38.86 
 
 		 228 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  38.75 
 
 		 239 aa  131  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  38.72 
 
 		 234 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  37.24 
 
 		 239 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  37.5 
 
 		 239 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  37.82 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  37.34 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  37.34 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  39.32 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  37.13 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  38.89 
 
 		 233 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  38.16 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  38.56 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  37.39 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  38.2 
 
 		 232 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  38.89 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  38.24 
 
 		 237 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.97 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  38.66 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  38.4 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  36.61 
 
 		 253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  36.86 
 
 		 235 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  40.6 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.07 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  40.71 
 
 		 230 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  35.95 
 
 		 241 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.36 
 
 		 215 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.23 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.38 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.31 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  39 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.93 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  37.5 
 
 		 222 aa  120  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  36.27 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  39.65 
 
 		 241 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  36.45 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  36.45 
 
 		 269 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  36.45 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  36.45 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  36.45 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  36.45 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  36.45 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  36.45 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.73 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  36.32 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  36.45 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  40.7 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  37.56 
 
 		 226 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  35.96 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  35.29 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  42.86 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.89 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  40.39 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  42.86 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 258 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.27 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  38.07 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2012  LexA repressor  40.76 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.47 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  42.23 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  33.65 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  40.76 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  40.76 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  45.59 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  40.76 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  40.76 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  40.76 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  40.76 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2481  LexA repressor  40.76 
 
 		 235 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.47 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  39.2 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  41.67 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  38.68 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1787  LexA repressor  39.39 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.916871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2471  LexA repressor  37.74 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.643159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>