More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0927 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  45.96 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.73 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  42.71 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  42.36 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.61 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.92 
 
 		 196 aa  148  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  38.76 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.89 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  43.09 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.2 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  41.84 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  40.98 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  40.98 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.44 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  40.49 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0501  transcriptional repressor, LexA family  33.61 
 
 		 249 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.862173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.19 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  40.2 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  40.2 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  40 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  40 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  39.41 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.9 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  39.51 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  42 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0518  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.6 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  41.18 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.26 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.92 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  35.84 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 205 aa  134  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.23 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.37 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  37.56 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  37.56 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.31 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.25 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  37.81 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.43 
 
 		 217 aa  131  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.12 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.59 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  35.27 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  37.25 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  35.96 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  39.7 
 
 		 226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  35.53 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  35.53 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  35.34 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.09 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.38 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1898  LexA repressor  33.86 
 
 		 251 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.58 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  36.59 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  40.1 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.83 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  33.91 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  34.6 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.78 
 
 		 228 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  37.44 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.61 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  32.76 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  32.34 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  33.76 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.19 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  35 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.89 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  38.81 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  32.78 
 
 		 241 aa  124  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  32.14 
 
 		 253 aa  124  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  35.06 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  31.76 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  38.58 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  37.68 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  33.33 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.58 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  32.05 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.76 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  36.5 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 258 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1179  LexA repressor  36.49 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865174  normal  0.239395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  34.45 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  37.44 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  33.62 
 
 		 232 aa  121  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  37.88 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.88 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  37.88 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  37.88 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  37.88 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  30.93 
 
 		 236 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  37.88 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  37.88 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>