More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1617 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  68.97 
 
 		 201 aa  284  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  63.05 
 
 		 201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  64.71 
 
 		 201 aa  264  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  65.2 
 
 		 201 aa  264  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60.78 
 
 		 201 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  61.58 
 
 		 209 aa  240  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.84 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.92 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  50.25 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  48.02 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  44.5 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  44.5 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  44.5 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  44.5 
 
 		 269 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  44.5 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  44.5 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  44.5 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  44.5 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  44.5 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  44.93 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  44.02 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.29 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  41.92 
 
 		 230 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.11 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  44.71 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.48 
 
 		 231 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.63 
 
 		 197 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.38 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.48 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  44.08 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  45.37 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.28 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  43.81 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.44 
 
 		 215 aa  160  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.21 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.19 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.16 
 
 		 205 aa  157  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  43.12 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.09 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  40.36 
 
 		 230 aa  155  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  40.7 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  40.7 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.12 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  40.98 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.26 
 
 		 235 aa  153  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  42.65 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  42.65 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.14 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  41.43 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  41.4 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  43.13 
 
 		 212 aa  150  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  41.67 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  39.39 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.38 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  41.94 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.73 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  40.93 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  40.93 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.1 
 
 		 243 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  40.93 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.09 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  40.59 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  39.52 
 
 		 261 aa  148  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.18 
 
 		 219 aa  148  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  41.12 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.75 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  40.47 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.01 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  40.98 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  42.31 
 
 		 233 aa  143  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  40.95 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  40.2 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  38.94 
 
 		 250 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  41.18 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  40.59 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  39.53 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0418  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.63 
 
 		 239 aa  141  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000022739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  40.59 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  42.29 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  40.2 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  39.27 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  43.07 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  43.07 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.58 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.12 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.61 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  42.16 
 
 		 204 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  41.67 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  42.08 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  37.93 
 
 		 256 aa  136  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2007  LexA repressor  42.79 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.417718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.52 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.38 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>