More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2782 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  100 
 
 
235 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  71.85 
 
 
237 aa  327  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  68.75 
 
 
239 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  68.18 
 
 
240 aa  314  9e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  68.18 
 
 
240 aa  314  9e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  68.46 
 
 
239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  68.33 
 
 
232 aa  308  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  68.05 
 
 
239 aa  307  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  67.77 
 
 
236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  68.46 
 
 
239 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  66.25 
 
 
238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  65.82 
 
 
237 aa  301  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  65.15 
 
 
237 aa  292  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  59.92 
 
 
242 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  64.56 
 
 
228 aa  285  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  63.9 
 
 
236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  60.17 
 
 
239 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  60.49 
 
 
240 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  60.42 
 
 
240 aa  278  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  61.67 
 
 
236 aa  277  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  60 
 
 
232 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  60.59 
 
 
233 aa  275  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  60.17 
 
 
233 aa  275  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  59.58 
 
 
240 aa  275  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  59.58 
 
 
240 aa  275  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  59.92 
 
 
237 aa  274  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  59.07 
 
 
234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  59.92 
 
 
235 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  60.59 
 
 
231 aa  265  5.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  60.59 
 
 
228 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  56.6 
 
 
231 aa  255  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1898  LexA repressor  55.38 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  58.09 
 
 
241 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  59.83 
 
 
232 aa  252  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  56.5 
 
 
234 aa  249  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  57.2 
 
 
227 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  57.2 
 
 
228 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  56.17 
 
 
224 aa  237  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  56.6 
 
 
227 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  54.33 
 
 
253 aa  231  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  37.66 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  38.36 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  39.74 
 
 
252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.5 
 
 
241 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.19 
 
 
213 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  36.21 
 
 
222 aa  141  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.6 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  36.05 
 
 
230 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  39.22 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.33 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  34.48 
 
 
236 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.9 
 
 
214 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.63 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  36.21 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.34 
 
 
235 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.87 
 
 
243 aa  135  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  34.32 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  35.34 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  35.59 
 
 
206 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  33.62 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.91 
 
 
235 aa  134  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  35.59 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  36.21 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  35.59 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  35.59 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  35.59 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  35.17 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  35.59 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  37.02 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  35.59 
 
 
269 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  35.59 
 
 
223 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  35.56 
 
 
210 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.33 
 
 
227 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  35.59 
 
 
223 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  37.34 
 
 
288 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  35.59 
 
 
223 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  35.78 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.93 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.84 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.06 
 
 
244 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.71 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.06 
 
 
217 aa  129  6e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  38.28 
 
 
226 aa  128  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  34.05 
 
 
217 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  35 
 
 
207 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  36.64 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.06 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  34.91 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  33.76 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.19 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.05 
 
 
204 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  33.33 
 
 
207 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  35.21 
 
 
244 aa  126  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  33.33 
 
 
207 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  36.86 
 
 
197 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  38.1 
 
 
230 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.89 
 
 
231 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.76 
 
 
206 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.48 
 
 
229 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>