More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0145 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  100 
 
 		 253 aa  505  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  66.8 
 
 		 231 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  57.81 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  56.03 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  55.29 
 
 		 233 aa  264  8e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  54.9 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  54.62 
 
 		 239 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  58.91 
 
 		 237 aa  262  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  56.59 
 
 		 239 aa  261  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  54.72 
 
 		 237 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  53.91 
 
 		 237 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  55.56 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  55.56 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  56.86 
 
 		 233 aa  258  7e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1898  LexA repressor  54.47 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  55.81 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  56.13 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  54.09 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  54.44 
 
 		 239 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  55 
 
 		 239 aa  255  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  54.69 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  53.91 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  56.03 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  54.05 
 
 		 239 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  56.2 
 
 		 236 aa  252  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  54.33 
 
 		 235 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  53.67 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  53.67 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  54.72 
 
 		 228 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  52.9 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  54.55 
 
 		 240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  52.92 
 
 		 232 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  51.57 
 
 		 231 aa  238  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  50.79 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  52.17 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  53.36 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  52.76 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  52.57 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  52.17 
 
 		 227 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  49.61 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  36.11 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  37.2 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  33.86 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  36.25 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  34.92 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.94 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  35.06 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  35.86 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  34.26 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  33.47 
 
 		 204 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.86 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.46 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  36.33 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  34.66 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.52 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  36.51 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.81 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  33.07 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  34.92 
 
 		 256 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  32.41 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.6 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.86 
 
 		 228 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34 
 
 		 241 aa  122  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  32.67 
 
 		 230 aa  122  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.66 
 
 		 238 aa  121  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.29 
 
 		 213 aa  121  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.06 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  34.26 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  30.16 
 
 		 206 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  31.47 
 
 		 204 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.2 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  29.76 
 
 		 207 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  29.76 
 
 		 207 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  33.86 
 
 		 233 aa  118  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.27 
 
 		 233 aa  118  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  32 
 
 		 203 aa  118  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  29.88 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  50.76 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  31.6 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.4 
 
 		 219 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.2 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  31.87 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  34.13 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.48 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  29.76 
 
 		 223 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.88 
 
 		 212 aa  115  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  29.76 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  30.83 
 
 		 210 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  29.76 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  34.25 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.55 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.05 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.2 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.24 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  31.87 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  30.68 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  31.08 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>