More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0167 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  100 
 
 		 241 aa  497  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  69.47 
 
 		 244 aa  316  2e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  56.79 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  51.79 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  52.56 
 
 		 246 aa  251  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.9 
 
 		 258 aa  248  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  54.11 
 
 		 263 aa  244  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  55.26 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  53.68 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  54.47 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.95 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.17 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  55.26 
 
 		 217 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  53.98 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  52.89 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  52.63 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  51.46 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  52.63 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  52.63 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  54.39 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.1 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  52.72 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  53.11 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  52.63 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  52.28 
 
 		 229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  53.07 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  50.43 
 
 		 236 aa  232  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  52.81 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  51.5 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.68 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  51.06 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  48.33 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  51.32 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  52 
 
 		 219 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  51.11 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  50.22 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.29 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  48.7 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.67 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.22 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.61 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.64 
 
 		 196 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.67 
 
 		 212 aa  175  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.22 
 
 		 204 aa  175  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  42.22 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.22 
 
 		 217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  41.92 
 
 		 204 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  43.17 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  42.73 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  41.08 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  42.29 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  42.29 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.7 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  42.29 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  42.29 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  42.29 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  42.29 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  42.29 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  42.29 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  42.29 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  42.29 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.89 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.77 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  42.29 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.4 
 
 		 222 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  39.47 
 
 		 202 aa  158  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.01 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  38.6 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  39.04 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  39.04 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  37.22 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  37.22 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.3 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  37.66 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.66 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  37.97 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.41 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  40.6 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  39.22 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  38.75 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  38.75 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  39.83 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  39.91 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  36.93 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  36.25 
 
 		 242 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  38.53 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  38.75 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  38.3 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  37.82 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  41.98 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  37.82 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  38.4 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  39.47 
 
 		 202 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.93 
 
 		 231 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  40.09 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  41.51 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  34.67 
 
 		 204 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  39.5 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>