More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2214 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  91.36 
 
 
232 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  90 
 
 
232 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  90.23 
 
 
217 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  77.25 
 
 
236 aa  334  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  73.03 
 
 
233 aa  331  5e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  71.11 
 
 
263 aa  320  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  73.93 
 
 
252 aa  314  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  70.7 
 
 
238 aa  309  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  70.18 
 
 
229 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  69.09 
 
 
236 aa  304  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  68.47 
 
 
252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  68.84 
 
 
258 aa  299  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  66.2 
 
 
235 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  65.11 
 
 
256 aa  295  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  65.53 
 
 
258 aa  294  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  66.23 
 
 
275 aa  294  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  66.97 
 
 
243 aa  294  9e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  70.7 
 
 
235 aa  293  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  66.98 
 
 
261 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  64.6 
 
 
219 aa  288  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  63.18 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  59.2 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  64.16 
 
 
234 aa  278  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60.54 
 
 
233 aa  276  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60.17 
 
 
228 aa  271  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  63.98 
 
 
252 aa  268  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  59.73 
 
 
244 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  57.83 
 
 
249 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  61.68 
 
 
227 aa  254  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  61.26 
 
 
239 aa  254  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  56.83 
 
 
288 aa  254  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  58.26 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  56.28 
 
 
241 aa  252  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  52.63 
 
 
241 aa  237  9e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  53.6 
 
 
244 aa  228  5e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  50.48 
 
 
204 aa  214  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  55.87 
 
 
219 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  48.36 
 
 
207 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  48.82 
 
 
207 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  47.66 
 
 
202 aa  193  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.4 
 
 
213 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.98 
 
 
207 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  47.87 
 
 
204 aa  191  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  46.45 
 
 
222 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  46.26 
 
 
207 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  46.26 
 
 
207 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.58 
 
 
214 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  46.48 
 
 
206 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  46.48 
 
 
204 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  43.93 
 
 
206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.55 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  46.01 
 
 
206 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  46.95 
 
 
269 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  46.01 
 
 
206 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  46.95 
 
 
269 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  46.01 
 
 
206 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  46.01 
 
 
206 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  46.01 
 
 
223 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  46.01 
 
 
223 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  46.01 
 
 
223 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  43.13 
 
 
204 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.02 
 
 
206 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.02 
 
 
205 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.13 
 
 
212 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.76 
 
 
196 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  42.86 
 
 
203 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  42.38 
 
 
203 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.81 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.52 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  41.41 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  41.23 
 
 
204 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.93 
 
 
212 aa  161  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  42.58 
 
 
212 aa  158  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  40.76 
 
 
208 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  43.19 
 
 
201 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 
212 aa  153  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  41.9 
 
 
207 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.13 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  40.93 
 
 
203 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.56 
 
 
217 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  41.23 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.35 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.61 
 
 
231 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.09 
 
 
200 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.74 
 
 
229 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.79 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  38.53 
 
 
233 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  43.22 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  37.82 
 
 
240 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  38.7 
 
 
232 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.6 
 
 
201 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  38.03 
 
 
236 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  37.39 
 
 
240 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  39.72 
 
 
197 aa  136  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  37.39 
 
 
240 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.38 
 
 
207 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  36.24 
 
 
201 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>