More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1758 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  96.52 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  69.31 
 
 		 201 aa  277  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  68.81 
 
 		 201 aa  277  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  64.71 
 
 		 203 aa  264  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  63.68 
 
 		 201 aa  262  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  59.9 
 
 		 200 aa  242  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  59.7 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  52.34 
 
 		 217 aa  225  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.26 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  44.44 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  43.54 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  43.54 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.16 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  44.12 
 
 		 222 aa  168  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  43.54 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  43.54 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  43.81 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  43.54 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  43.54 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  43.54 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  44.02 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  43.54 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  43.54 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  45.85 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.27 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  43.75 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.28 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.46 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  40.95 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  39.81 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  39.81 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.55 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  40.83 
 
 		 238 aa  154  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.08 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  40.89 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  40.89 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.93 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  41.38 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  39.71 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.51 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.62 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  37.95 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.21 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.7 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  38.86 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.04 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  39.81 
 
 		 226 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.43 
 
 		 235 aa  144  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.39 
 
 		 222 aa  144  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.65 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  38.25 
 
 		 236 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.79 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.71 
 
 		 235 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.35 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  41.9 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  42.79 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.5 
 
 		 233 aa  141  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  40.8 
 
 		 202 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  40.8 
 
 		 202 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  40.8 
 
 		 202 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  40.8 
 
 		 202 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  40.8 
 
 		 202 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.81 
 
 		 243 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.25 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  39.7 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.7 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  39.7 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  39.7 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  39.7 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  39.7 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  39.7 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  39.7 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  39.7 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  39.11 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  41.06 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  37.91 
 
 		 261 aa  138  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  40.31 
 
 		 201 aa  137  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  39.3 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 258 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  39.3 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  39.2 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  39.2 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  39.2 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  38.12 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  38.36 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  36.24 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  38.81 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  36.24 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  36.24 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.91 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  36.41 
 
 		 217 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  41.09 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.57 
 
 		 252 aa  134  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.94 
 
 		 231 aa  134  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0418  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.65 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000022739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>