More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3510 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  100 
 
 		 256 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  74.32 
 
 		 250 aa  359  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  66.94 
 
 		 263 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  62.89 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  61.54 
 
 		 230 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  61.54 
 
 		 230 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  61.54 
 
 		 230 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  65.94 
 
 		 238 aa  295  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  64.46 
 
 		 229 aa  291  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  65.8 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  64.26 
 
 		 217 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  63.07 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  65.52 
 
 		 232 aa  289  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60.87 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  64.56 
 
 		 258 aa  288  8e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  61.67 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  61.96 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  60.47 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  65.37 
 
 		 258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  65.09 
 
 		 235 aa  281  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  62.01 
 
 		 236 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  65.8 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  61.67 
 
 		 261 aa  280  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  64.91 
 
 		 219 aa  278  6e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  56.81 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  57.31 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  58.77 
 
 		 233 aa  258  7e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  56.96 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  59.5 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.33 
 
 		 241 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  52.08 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  59.21 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  54.78 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  58.01 
 
 		 252 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  57.81 
 
 		 239 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.17 
 
 		 227 aa  234  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  48.33 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.13 
 
 		 204 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  50.87 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  47.62 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  46.93 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  45.02 
 
 		 202 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  45.18 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  42.54 
 
 		 204 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  44.3 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  44.3 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.98 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  42.11 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  45.18 
 
 		 223 aa  178  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  45.18 
 
 		 223 aa  178  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  45.18 
 
 		 223 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  45.18 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  45.18 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.11 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  45.18 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  45.18 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  45.18 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  45.18 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.7 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.3 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  44.16 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.3 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  40.69 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  40.69 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  40.69 
 
 		 206 aa  172  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.94 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.48 
 
 		 207 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.67 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.15 
 
 		 206 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.82 
 
 		 215 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.04 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 204 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  37.61 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  37.17 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.37 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.95 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  40.27 
 
 		 212 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.63 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  40.71 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  41.15 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  39.29 
 
 		 208 aa  149  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  42.37 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.6 
 
 		 231 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  42.38 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  37.93 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.76 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.63 
 
 		 200 aa  138  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  39.58 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  37.55 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  39.92 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  36.55 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  37.5 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  37.83 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  40 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.89 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 197 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  37.02 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  37.92 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  37.92 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>