More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1874 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  100 
 
 
228 aa  455  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  73.59 
 
 
231 aa  332  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  73.68 
 
 
228 aa  330  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  70.82 
 
 
232 aa  320  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  69.71 
 
 
241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  71.05 
 
 
228 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  70.48 
 
 
227 aa  307  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  65.02 
 
 
239 aa  299  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  64.73 
 
 
237 aa  290  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  66.11 
 
 
239 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  63.22 
 
 
240 aa  287  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  63.22 
 
 
240 aa  287  8e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  65.69 
 
 
239 aa  286  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  64.56 
 
 
235 aa  285  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  65.13 
 
 
238 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  62.61 
 
 
237 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  61.67 
 
 
239 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  61.25 
 
 
239 aa  279  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  62.87 
 
 
236 aa  277  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  59.26 
 
 
242 aa  274  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  62.34 
 
 
236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  61.11 
 
 
232 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  60.26 
 
 
233 aa  269  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  59.75 
 
 
236 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  60.08 
 
 
237 aa  268  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  61 
 
 
240 aa  268  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  59.75 
 
 
240 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  59.75 
 
 
240 aa  268  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  58.97 
 
 
233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  58.3 
 
 
240 aa  265  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  59.66 
 
 
234 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  57.98 
 
 
237 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  60.09 
 
 
232 aa  259  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  58.05 
 
 
235 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  55.17 
 
 
231 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1898  LexA repressor  49.6 
 
 
251 aa  232  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  52.1 
 
 
227 aa  222  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  51.05 
 
 
234 aa  221  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  50.79 
 
 
253 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  53.07 
 
 
224 aa  217  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  36.44 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  36.89 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  36.89 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  36.89 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  36.89 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  36.89 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  36.89 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  36.89 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  36.89 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  36.89 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  36 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  36 
 
 
207 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  38.22 
 
 
222 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  40 
 
 
238 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.68 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  38.53 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  39.74 
 
 
197 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  34.8 
 
 
207 aa  138  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  38.63 
 
 
275 aa  138  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  39.56 
 
 
236 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  38.72 
 
 
252 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  38.22 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.56 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  35.27 
 
 
203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  35.27 
 
 
203 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  35.84 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  36.44 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  36.4 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  38.2 
 
 
246 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  35.4 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  35.4 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  37.33 
 
 
258 aa  131  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.7 
 
 
234 aa  131  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.44 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  37.78 
 
 
263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.56 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  38.22 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.22 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.53 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.61 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  38.5 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.05 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.73 
 
 
205 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  33.78 
 
 
202 aa  128  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.05 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.12 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  37.78 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  37.78 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  37.78 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  37.78 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.19 
 
 
207 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  34.2 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  37.87 
 
 
256 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.89 
 
 
197 aa  125  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  32.89 
 
 
197 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.56 
 
 
231 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.56 
 
 
212 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  38.63 
 
 
244 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  35.81 
 
 
232 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.24 
 
 
228 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>