More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0581 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  100 
 
 
210 aa  430  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  43.56 
 
 
227 aa  175  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  44.76 
 
 
204 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  38.71 
 
 
207 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.04 
 
 
217 aa  156  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  39.34 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  41.38 
 
 
234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  39.81 
 
 
206 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  42.15 
 
 
224 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  38.43 
 
 
206 aa  152  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  38.94 
 
 
222 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.44 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  39.34 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  39.34 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  39.34 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  39.34 
 
 
206 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  39.34 
 
 
206 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  39.34 
 
 
206 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  39.34 
 
 
206 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.55 
 
 
204 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.76 
 
 
206 aa  149  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  39.34 
 
 
269 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  39.81 
 
 
204 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  37.96 
 
 
207 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  39.34 
 
 
269 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  37.96 
 
 
207 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  37.68 
 
 
203 aa  148  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  38.79 
 
 
233 aa  148  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  37.68 
 
 
203 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  39.62 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.5 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.44 
 
 
215 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.38 
 
 
206 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  39.35 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  41.98 
 
 
261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.55 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.67 
 
 
209 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  37.5 
 
 
233 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  41.23 
 
 
204 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  36.86 
 
 
237 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  39.81 
 
 
258 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  38.7 
 
 
231 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  38.18 
 
 
214 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  36.36 
 
 
232 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  40.74 
 
 
198 aa  141  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  36.91 
 
 
234 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.5 
 
 
207 aa  141  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  37.18 
 
 
235 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  37 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1481  peptidase S24, LexA repressor  36.49 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.939319  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19141  SOS function regulatory protein, LexA repressor  37.62 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.212915 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  36.4 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  37.44 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  36.17 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  40.38 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  36.4 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.07 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  36.56 
 
 
227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.79 
 
 
213 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  37.23 
 
 
232 aa  138  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  36.11 
 
 
253 aa  138  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  38.46 
 
 
230 aa  137  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2186  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.38 
 
 
200 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2248  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.38 
 
 
200 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0496433  normal  0.289042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1071  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.83 
 
 
218 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  39.51 
 
 
226 aa  136  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13051  SOS function regulatory protein, LexA repressor  35.07 
 
 
202 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  35.15 
 
 
239 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.38 
 
 
196 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.03 
 
 
212 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16801  SOS function regulatory protein, LexA repressor  36.19 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0929  LexA repressor  36.19 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  35.56 
 
 
235 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0828  SOS function regulatory protein, LexA repressor  36.19 
 
 
202 aa  134  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  34.75 
 
 
237 aa  134  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  35.59 
 
 
237 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.15 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  33.33 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.05 
 
 
201 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  36.79 
 
 
200 aa  132  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  33.05 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  35.59 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.26 
 
 
231 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  33.61 
 
 
242 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  36.54 
 
 
207 aa  131  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  33.89 
 
 
240 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  33.76 
 
 
239 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  34.93 
 
 
208 aa  131  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.48 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  33.33 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  33.61 
 
 
239 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  34.29 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  33.47 
 
 
240 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  37.09 
 
 
205 aa  129  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  35.93 
 
 
228 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  37.07 
 
 
230 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  33.47 
 
 
240 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  35.41 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>