More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2248 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2186  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 
200 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2248  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 
200 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0496433  normal  0.289042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  69.7 
 
 
201 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  62 
 
 
201 aa  258  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  62.31 
 
 
200 aa  258  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  58.25 
 
 
209 aa  244  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13051  SOS function regulatory protein, LexA repressor  54.82 
 
 
202 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16801  SOS function regulatory protein, LexA repressor  54.82 
 
 
202 aa  231  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0828  SOS function regulatory protein, LexA repressor  54.82 
 
 
202 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19141  SOS function regulatory protein, LexA repressor  55.9 
 
 
198 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.212915 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1481  peptidase S24, LexA repressor  53.77 
 
 
207 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.939319  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0929  LexA repressor  53.27 
 
 
207 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14231  SOS function regulatory protein, LexA repressor  50.25 
 
 
210 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14471  SOS function regulatory protein, LexA repressor  48.22 
 
 
205 aa  212  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.972775  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  49.24 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1356  SOS function regulatory protein, LexA repressor  48.48 
 
 
205 aa  204  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  37.38 
 
 
210 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.64 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  34.47 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.33 
 
 
200 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.5 
 
 
196 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  30.26 
 
 
227 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  31.2 
 
 
232 aa  104  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  31 
 
 
203 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.65 
 
 
215 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  31 
 
 
203 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  34.62 
 
 
205 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  34.44 
 
 
198 aa  101  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  31.5 
 
 
197 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  31.3 
 
 
228 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.48 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.52 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  33.33 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  33.19 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  31.73 
 
 
223 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  31.58 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.64 
 
 
243 aa  97.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  31.73 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  34.15 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  31.73 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  31.73 
 
 
223 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  31.73 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  31.73 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  31.42 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  32.7 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  31.73 
 
 
223 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  31.73 
 
 
269 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  31.73 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  30.88 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  32.7 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.37 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.13 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  32.84 
 
 
202 aa  94  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  28.87 
 
 
237 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  32.18 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  30.95 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  28.57 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.69 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1543  transcriptional repressor, LexA family  33.5 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734536 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  30.95 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.36 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1868  LexA repressor  33.5 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  31.1 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  29.57 
 
 
228 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  33.5 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  33.66 
 
 
205 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  31.31 
 
 
214 aa  92  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  28.7 
 
 
228 aa  92  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  28.51 
 
 
233 aa  92  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0386  LexA repressor  32.21 
 
 
210 aa  92  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.37 
 
 
231 aa  92  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0507519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  31.53 
 
 
202 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.53 
 
 
202 aa  92  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  31.53 
 
 
202 aa  92  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  31.53 
 
 
202 aa  92  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  34.31 
 
 
205 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  29.13 
 
 
227 aa  91.7  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.67 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  31.53 
 
 
202 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  31.53 
 
 
202 aa  92  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  31.53 
 
 
202 aa  92  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  31.53 
 
 
202 aa  92  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  31.53 
 
 
202 aa  92  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.13 
 
 
215 aa  91.7  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  31.07 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  32.35 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  32.02 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.91 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.29 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  32.23 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.4 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  26.92 
 
 
232 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  32.18 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  29.56 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  29.41 
 
 
236 aa  89.4  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  27.98 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  28.39 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  31.03 
 
 
202 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  31.03 
 
 
202 aa  89  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>