More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1356 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1356  SOS function regulatory protein, LexA repressor  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14471  SOS function regulatory protein, LexA repressor  68.66 
 
 		 205 aa  297  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.972775  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14231  SOS function regulatory protein, LexA repressor  68.66 
 
 		 210 aa  295  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  68.53 
 
 		 205 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16801  SOS function regulatory protein, LexA repressor  63.68 
 
 		 202 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0828  SOS function regulatory protein, LexA repressor  63.68 
 
 		 202 aa  282  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13051  SOS function regulatory protein, LexA repressor  61.69 
 
 		 202 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0929  LexA repressor  60.7 
 
 		 207 aa  271  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1481  peptidase S24, LexA repressor  59.41 
 
 		 207 aa  271  7e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.939319  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19141  SOS function regulatory protein, LexA repressor  59.6 
 
 		 198 aa  268  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.212915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.54 
 
 		 201 aa  227  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  55.1 
 
 		 200 aa  225  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.77 
 
 		 209 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  51.78 
 
 		 201 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2186  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.48 
 
 		 200 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2248  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.48 
 
 		 200 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0496433  normal  0.289042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  32.33 
 
 		 231 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  31.75 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.55 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  31 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  31.3 
 
 		 227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  31.91 
 
 		 241 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  32.02 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.5 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  31.47 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  34.25 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  33.83 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  33.83 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  32.33 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  31.37 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  30.25 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.65 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  30.25 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  34.4 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  32.67 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  29.52 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.66 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  29.52 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  31.36 
 
 		 235 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  30.8 
 
 		 236 aa  101  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  32.02 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  31.14 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  30.3 
 
 		 231 aa  101  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  32.68 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  32.68 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  32.68 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  32.68 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  32.68 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  32.68 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  32.68 
 
 		 269 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.86 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  33.33 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.65 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  32.68 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  31.84 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  31.58 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  28.23 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  32.68 
 
 		 269 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  30.43 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  29.61 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  31.02 
 
 		 261 aa  99.4  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  32.84 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.84 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 258 aa  99  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  32.84 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  32.84 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  32.84 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  32.84 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  32.84 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  32.84 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  32.84 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  30.67 
 
 		 238 aa  98.6  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  29.61 
 
 		 232 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  29.91 
 
 		 233 aa  98.2  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1543  transcriptional repressor, LexA family  32 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1868  LexA repressor  32 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  32.34 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  32.34 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  31.22 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 197 aa  98.2  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  32.34 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  32.34 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  32.34 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  31.47 
 
 		 197 aa  97.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  32.35 
 
 		 203 aa  97.8  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  29.79 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  29.29 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  29.88 
 
 		 241 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  32.67 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.43 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.3 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.1 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  29.71 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  29.49 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.02 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  29.29 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>