More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1232 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  63.45 
 
 
200 aa  260  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  64.14 
 
 
201 aa  257  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  63 
 
 
201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60.2 
 
 
201 aa  242  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  59.7 
 
 
201 aa  241  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60 
 
 
201 aa  240  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  61.58 
 
 
203 aa  240  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.95 
 
 
217 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.51 
 
 
200 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  44.93 
 
 
204 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  44.66 
 
 
207 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  46.12 
 
 
207 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  43.54 
 
 
223 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  43.54 
 
 
206 aa  168  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  43.54 
 
 
206 aa  168  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  43.54 
 
 
206 aa  168  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  43.54 
 
 
223 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  43.54 
 
 
206 aa  168  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  43.54 
 
 
223 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  43.54 
 
 
269 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  43.54 
 
 
269 aa  167  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  45.37 
 
 
222 aa  167  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  43.54 
 
 
206 aa  165  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.75 
 
 
205 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.78 
 
 
215 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  42.08 
 
 
203 aa  157  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.58 
 
 
207 aa  157  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.44 
 
 
204 aa  157  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  42.08 
 
 
203 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42 
 
 
197 aa  154  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  42 
 
 
197 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  44.33 
 
 
202 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  40.59 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.07 
 
 
213 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.4 
 
 
212 aa  149  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.2 
 
 
196 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.74 
 
 
222 aa  148  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  40.67 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  40 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  40 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.09 
 
 
228 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.91 
 
 
229 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  37.38 
 
 
204 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  39.74 
 
 
230 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  43.37 
 
 
202 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  40.5 
 
 
207 aa  142  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.37 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  39.06 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.77 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.93 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  41.26 
 
 
212 aa  138  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  40.29 
 
 
210 aa  138  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  39.71 
 
 
226 aa  137  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.27 
 
 
215 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40 
 
 
235 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  38.42 
 
 
204 aa  134  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  37.2 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.1 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  40.2 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  38.99 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.42 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.38 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.39 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.5 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  36.95 
 
 
208 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.4 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  41.87 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  38.07 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.45 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40 
 
 
235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  39.29 
 
 
202 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.29 
 
 
202 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.78 
 
 
214 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  39.29 
 
 
202 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  39.29 
 
 
202 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  39.29 
 
 
202 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  39.29 
 
 
202 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.15 
 
 
234 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  39.29 
 
 
202 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.58 
 
 
206 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  39.29 
 
 
202 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  39.29 
 
 
202 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  36.49 
 
 
258 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3234  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.28 
 
 
216 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  38.78 
 
 
202 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  37.96 
 
 
230 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  37.96 
 
 
230 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  37.96 
 
 
230 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.18 
 
 
199 aa  122  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  37.14 
 
 
210 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  38.61 
 
 
210 aa  122  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  38.78 
 
 
202 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  39.09 
 
 
201 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  38.78 
 
 
202 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  38.78 
 
 
202 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  38.78 
 
 
202 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  38.78 
 
 
202 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.89 
 
 
227 aa  121  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>