More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0192 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 
200 aa  407  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  63.45 
 
 
209 aa  260  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  60.4 
 
 
201 aa  244  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  59.9 
 
 
201 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  59.9 
 
 
201 aa  242  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  59.9 
 
 
201 aa  240  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60.4 
 
 
201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  53.92 
 
 
203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.07 
 
 
217 aa  202  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.51 
 
 
200 aa  188  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  45.59 
 
 
202 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  44.93 
 
 
207 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.56 
 
 
204 aa  165  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  45.77 
 
 
222 aa  165  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  43.48 
 
 
207 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45 
 
 
197 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  41.58 
 
 
204 aa  158  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  43.27 
 
 
223 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  40.67 
 
 
206 aa  157  7e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  43.27 
 
 
223 aa  157  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  43.27 
 
 
223 aa  157  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  43.27 
 
 
206 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  42.86 
 
 
206 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  43.27 
 
 
206 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  44 
 
 
197 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  43.27 
 
 
206 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  43.69 
 
 
204 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  43.43 
 
 
203 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  42.93 
 
 
203 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.61 
 
 
207 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  43.27 
 
 
206 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  43.27 
 
 
269 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  43.27 
 
 
269 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.51 
 
 
196 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  39.05 
 
 
207 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  39.05 
 
 
207 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.55 
 
 
222 aa  151  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.39 
 
 
213 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.92 
 
 
205 aa  148  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.29 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.45 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.71 
 
 
212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.38 
 
 
215 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.17 
 
 
228 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  39.83 
 
 
230 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40 
 
 
229 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.57 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.11 
 
 
215 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  41.21 
 
 
202 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.7 
 
 
207 aa  138  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  40.49 
 
 
207 aa  138  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  42.58 
 
 
212 aa  137  8.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  40.1 
 
 
204 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  41 
 
 
226 aa  136  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.04 
 
 
214 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.32 
 
 
235 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  36.87 
 
 
238 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  38.29 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  36.45 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  36.92 
 
 
232 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  36.82 
 
 
236 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.65 
 
 
229 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  36.45 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  36.45 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  39.51 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  36.45 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  37.38 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  41.67 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.68 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  36.32 
 
 
208 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.51 
 
 
217 aa  129  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  37.02 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.07 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  35.41 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  36.62 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  40.82 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1832  transcriptional repressor, LexA family  38.61 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.46 
 
 
235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  34.26 
 
 
263 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  34.45 
 
 
261 aa  124  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  38.32 
 
 
214 aa  123  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  36.63 
 
 
210 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  39.5 
 
 
205 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.76 
 
 
206 aa  123  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.05 
 
 
231 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  33.91 
 
 
275 aa  123  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  39.22 
 
 
210 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.5 
 
 
207 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.32 
 
 
219 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.58 
 
 
199 aa  122  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  33.93 
 
 
250 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  38.07 
 
 
211 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  36.18 
 
 
207 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.38 
 
 
198 aa  122  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  41.11 
 
 
198 aa  121  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3234  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.25 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168509 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.87 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  35.43 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  38.61 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  38.35 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>