More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1207 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  100 
 
 
210 aa  424  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  36 
 
 
197 aa  141  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.81 
 
 
206 aa  131  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  37.07 
 
 
204 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  34.76 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  35.64 
 
 
205 aa  127  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.3 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  34.45 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  40.78 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.63 
 
 
200 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  34.65 
 
 
202 aa  122  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  34.03 
 
 
239 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  38.61 
 
 
209 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  34.97 
 
 
203 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  34.03 
 
 
239 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  35.47 
 
 
204 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  37.81 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  36 
 
 
204 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.81 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  35.61 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  35.61 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  35.61 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  35.61 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  37.81 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  37.99 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  35.61 
 
 
223 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  35.61 
 
 
223 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.79 
 
 
222 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.25 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  34.76 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.43 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  35.61 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  37.31 
 
 
197 aa  118  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  30.92 
 
 
202 aa  118  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  34.63 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  34.63 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.37 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  32.02 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.93 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  32.5 
 
 
240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  36.1 
 
 
201 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  35.32 
 
 
205 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  33.8 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1384  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.24 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0425171  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  34.33 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  38.42 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  35.58 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  33.33 
 
 
240 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  33.33 
 
 
240 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.81 
 
 
199 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2248  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.47 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0496433  normal  0.289042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2186  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.47 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  31.67 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.48 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  37.77 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  31.67 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_002936  DET1640  LexA repressor  35.24 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0943463  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1522  LexA repressor  35.24 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0737181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  34.18 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  31.55 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  32.49 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.59 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  31.17 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.24 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  37.86 
 
 
206 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  32.2 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  37.56 
 
 
207 aa  112  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  36.71 
 
 
207 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  36.71 
 
 
207 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  35.44 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.47 
 
 
198 aa  111  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  35.15 
 
 
201 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  33.19 
 
 
231 aa  111  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.71 
 
 
217 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  32.89 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.99 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  33.66 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.94 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  31.58 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  33.05 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3234  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.18 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  30.13 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  31.8 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.5 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  32.34 
 
 
235 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  32.46 
 
 
228 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.06 
 
 
227 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  30.83 
 
 
253 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  36.41 
 
 
201 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16801  SOS function regulatory protein, LexA repressor  30.35 
 
 
202 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.23 
 
 
215 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.98 
 
 
201 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  31.36 
 
 
236 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.47 
 
 
201 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  30.74 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0828  SOS function regulatory protein, LexA repressor  30.35 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.17 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  31.9 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  31.22 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>