More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1233 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 
209 aa  430  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  61.65 
 
 
201 aa  268  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  61.76 
 
 
200 aa  267  8.999999999999999e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60.98 
 
 
201 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2186  SOS-response transcriptional repressor, LexA  58.25 
 
 
200 aa  244  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2248  SOS-response transcriptional repressor, LexA  58.25 
 
 
200 aa  244  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0496433  normal  0.289042 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16801  SOS function regulatory protein, LexA repressor  54.19 
 
 
202 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13051  SOS function regulatory protein, LexA repressor  53.69 
 
 
202 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0828  SOS function regulatory protein, LexA repressor  54.19 
 
 
202 aa  238  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19141  SOS function regulatory protein, LexA repressor  55.22 
 
 
198 aa  235  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.212915 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0929  LexA repressor  53.69 
 
 
207 aa  234  6e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1481  peptidase S24, LexA repressor  54.19 
 
 
207 aa  231  5e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.939319  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14471  SOS function regulatory protein, LexA repressor  52.74 
 
 
205 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.972775  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14231  SOS function regulatory protein, LexA repressor  51.74 
 
 
210 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  51.24 
 
 
205 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1356  SOS function regulatory protein, LexA repressor  48.77 
 
 
205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  37.67 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  34.8 
 
 
203 aa  121  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  34.8 
 
 
203 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.2 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  36.49 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  31.37 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  38.04 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  34.78 
 
 
228 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  37.98 
 
 
210 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  36.23 
 
 
197 aa  115  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.48 
 
 
215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.97 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.95 
 
 
197 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  36.06 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.46 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  32.19 
 
 
231 aa  111  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  29.82 
 
 
227 aa  111  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  35.71 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  35.71 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  35.71 
 
 
269 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  33.48 
 
 
228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.57 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  32.54 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  32.48 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  32.74 
 
 
230 aa  109  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  35.71 
 
 
223 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.07 
 
 
205 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  35.71 
 
 
223 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  35.71 
 
 
223 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  35.71 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  35.71 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  35.71 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  35.71 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  30.86 
 
 
241 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  34.74 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.32 
 
 
227 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  32.85 
 
 
201 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.96 
 
 
243 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.55 
 
 
213 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  35.92 
 
 
197 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.49 
 
 
201 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  32.03 
 
 
228 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  28.87 
 
 
237 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.7 
 
 
200 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.62 
 
 
196 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.75 
 
 
207 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  29.18 
 
 
231 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  31.6 
 
 
227 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  34.35 
 
 
241 aa  104  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  33.8 
 
 
207 aa  104  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  29.24 
 
 
234 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  28.27 
 
 
235 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.57 
 
 
217 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.97 
 
 
199 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  30.13 
 
 
237 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  30.33 
 
 
203 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  29.83 
 
 
236 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  33.18 
 
 
208 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  33.66 
 
 
222 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  29.36 
 
 
233 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.7 
 
 
201 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.22 
 
 
207 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  37.1 
 
 
238 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  37.21 
 
 
252 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  30.64 
 
 
234 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  33.33 
 
 
202 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  28.51 
 
 
233 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  33.82 
 
 
207 aa  101  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  35.44 
 
 
205 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  29.41 
 
 
236 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  35.18 
 
 
204 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0108  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.54 
 
 
209 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341365  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  30.09 
 
 
224 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  32.23 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  28.03 
 
 
238 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.7 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  28.21 
 
 
232 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.48 
 
 
212 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  28.33 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  31.13 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  31.13 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  29.75 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  28.03 
 
 
237 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1868  LexA repressor  34.93 
 
 
205 aa  99  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>