More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_14611 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14231  SOS function regulatory protein, LexA repressor  89.11 
 
 
210 aa  380  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14471  SOS function regulatory protein, LexA repressor  82.44 
 
 
205 aa  350  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.972775  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13051  SOS function regulatory protein, LexA repressor  66.67 
 
 
202 aa  292  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1356  SOS function regulatory protein, LexA repressor  68.53 
 
 
205 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16801  SOS function regulatory protein, LexA repressor  64.65 
 
 
202 aa  285  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0828  SOS function regulatory protein, LexA repressor  64.65 
 
 
202 aa  285  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19141  SOS function regulatory protein, LexA repressor  63.45 
 
 
198 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.212915 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0929  LexA repressor  59.9 
 
 
207 aa  278  4e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1481  peptidase S24, LexA repressor  59.9 
 
 
207 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.939319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.84 
 
 
201 aa  234  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.05 
 
 
201 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  54.27 
 
 
200 aa  230  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  51.24 
 
 
209 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2248  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.24 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0496433  normal  0.289042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2186  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.24 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 
215 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  35.53 
 
 
228 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  34.56 
 
 
252 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  34.88 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  36.36 
 
 
206 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  32.89 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  32.54 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  31.9 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  33.48 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  34.76 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  33.19 
 
 
232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.41 
 
 
235 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  33.05 
 
 
233 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.48 
 
 
204 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  33.77 
 
 
231 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  33.62 
 
 
234 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  36.07 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  35.71 
 
 
206 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  35.71 
 
 
206 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  35.71 
 
 
206 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  35.71 
 
 
206 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  33.19 
 
 
237 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  33.05 
 
 
235 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  32.91 
 
 
233 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  33.66 
 
 
222 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  33.05 
 
 
239 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  32.49 
 
 
236 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  33.05 
 
 
239 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  35.71 
 
 
223 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  34.3 
 
 
239 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  35.71 
 
 
223 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  35.71 
 
 
223 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  32.77 
 
 
237 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  35.71 
 
 
269 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  35.71 
 
 
269 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  32.7 
 
 
207 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  33.19 
 
 
237 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  32.7 
 
 
207 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  33.99 
 
 
202 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  30.66 
 
 
258 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  35.1 
 
 
204 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  31.95 
 
 
240 aa  104  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  31.95 
 
 
240 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  34.16 
 
 
203 aa  104  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  33.47 
 
 
235 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  31.95 
 
 
240 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.82 
 
 
252 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  32.92 
 
 
239 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  34.16 
 
 
203 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.19 
 
 
235 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  32.49 
 
 
236 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  33.2 
 
 
238 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  30.19 
 
 
261 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  30.83 
 
 
239 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  30.71 
 
 
240 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  31.22 
 
 
236 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  31.51 
 
 
237 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.51 
 
 
201 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  33.33 
 
 
228 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  28.7 
 
 
263 aa  101  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.73 
 
 
227 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  29.31 
 
 
231 aa  101  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30 
 
 
207 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.54 
 
 
196 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.58 
 
 
229 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  33.5 
 
 
202 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  32.02 
 
 
201 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  32.85 
 
 
207 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  33.33 
 
 
210 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.41 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.82 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  32.37 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  32.06 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  32.37 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  31.8 
 
 
230 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  31.8 
 
 
230 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.53 
 
 
243 aa  99.4  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  31.8 
 
 
230 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  30.8 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  31.82 
 
 
238 aa  99  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  30.97 
 
 
224 aa  99  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.95 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  33.66 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  32.04 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>