More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2198 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 		 201 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  81.91 
 
 		 200 aa  348  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  67.17 
 
 		 201 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  61.65 
 
 		 209 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2186  SOS-response transcriptional repressor, LexA  62 
 
 		 200 aa  258  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2248  SOS-response transcriptional repressor, LexA  62 
 
 		 200 aa  258  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0496433  normal  0.289042 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13051  SOS function regulatory protein, LexA repressor  58.38 
 
 		 202 aa  242  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16801  SOS function regulatory protein, LexA repressor  57.36 
 
 		 202 aa  240  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0828  SOS function regulatory protein, LexA repressor  57.36 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0929  LexA repressor  57.29 
 
 		 207 aa  238  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14231  SOS function regulatory protein, LexA repressor  55.33 
 
 		 210 aa  237  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19141  SOS function regulatory protein, LexA repressor  56.92 
 
 		 198 aa  235  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.212915 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  55.84 
 
 		 205 aa  234  4e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1481  peptidase S24, LexA repressor  55.28 
 
 		 207 aa  234  6e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.939319  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1356  SOS function regulatory protein, LexA repressor  53.54 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14471  SOS function regulatory protein, LexA repressor  52.79 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.972775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  35.05 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  36.45 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.5 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.45 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.38 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  37.26 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.78 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  36.92 
 
 		 269 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  36.92 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  36.92 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  36.92 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  36.92 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  36.92 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  36.92 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  36.92 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  36.92 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.74 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  36.45 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  33.99 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  40 
 
 		 205 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.99 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.15 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  33.33 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  32.84 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3234  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.78 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168509 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  32.51 
 
 		 241 aa  104  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  33.8 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  35.61 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  33.48 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  35.56 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  32.9 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  32.22 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  32.71 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  35.61 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  34.95 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.95 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  34.95 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  34.95 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  34.95 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  34.95 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  33.33 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  34.95 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  34.95 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  34.95 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.64 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.45 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  32.21 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  36.59 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  33.98 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  30.37 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.67 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  33.98 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  33.98 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  33.98 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  33.98 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  32.21 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  34.16 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  35.12 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  34.31 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.34 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  33.97 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  31.86 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  36.1 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.48 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1543  transcriptional repressor, LexA family  34.48 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1868  LexA repressor  34.48 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  33.02 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  33.02 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  30.04 
 
 		 231 aa  98.2  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1071  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.51 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.49 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.98 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  31.06 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  33.61 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  35.27 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0386  LexA repressor  32.85 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  34.83 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  33.17 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  35.27 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  32.71 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>