More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2243 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  45.37 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  46.8 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.79 
 
 		 212 aa  160  8.000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  43.35 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.73 
 
 		 228 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.54 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  42.36 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.67 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  43.14 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.71 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.78 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  42.16 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.87 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.22 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.85 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  40.89 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  41.18 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  41.18 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  41.18 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  41.18 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  41.18 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  40.69 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  41.18 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  41.18 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  40.69 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  41.58 
 
 		 204 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  41.38 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  41.38 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  42.13 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  42.36 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.61 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  39.7 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.32 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  39.52 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.5 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  43.88 
 
 		 201 aa  144  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.32 
 
 		 227 aa  143  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.71 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  37.56 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  37.88 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  37.88 
 
 		 203 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.71 
 
 		 197 aa  141  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  39.45 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.57 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.61 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.1 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.68 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 214 aa  138  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.79 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  38.86 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  38.25 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  38.79 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  38.79 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.33 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  38.79 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  39.11 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.9 
 
 		 252 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  42.29 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 258 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.46 
 
 		 235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.4 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  38.84 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  39.19 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  39.7 
 
 		 210 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.71 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1522  LexA repressor  38.32 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0737181  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.7 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.11 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.71 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  42.71 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  38.39 
 
 		 217 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1384  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.32 
 
 		 214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0425171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  39.32 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.5 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1640  LexA repressor  38.21 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0943463  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  35.32 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  37.38 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  41.41 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.41 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  41.41 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  37.04 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  41.41 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  41.41 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  41.41 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  41.41 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  36.45 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  41.41 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  41.41 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  36.04 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.91 
 
 		 258 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.36 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  35.84 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  35.5 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.02 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  39.44 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  36.95 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>