More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3524 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  100 
 
 		 203 aa  413  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  97.04 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  91.13 
 
 		 202 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  90.15 
 
 		 202 aa  377  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  88.12 
 
 		 202 aa  367  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  88.12 
 
 		 202 aa  367  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  88.12 
 
 		 202 aa  367  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  87.62 
 
 		 202 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  88.61 
 
 		 202 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  87.62 
 
 		 202 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  87.62 
 
 		 202 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  87.62 
 
 		 202 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  87.62 
 
 		 202 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  87.13 
 
 		 202 aa  363  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  87.13 
 
 		 202 aa  362  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  87.13 
 
 		 202 aa  362  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  87.13 
 
 		 202 aa  362  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  87.13 
 
 		 202 aa  362  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  87.13 
 
 		 202 aa  362  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  87.13 
 
 		 202 aa  362  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  87.13 
 
 		 202 aa  362  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  87.13 
 
 		 202 aa  362  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  87.13 
 
 		 202 aa  362  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0386  LexA repressor  73.79 
 
 		 210 aa  312  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  74.04 
 
 		 209 aa  312  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  72.06 
 
 		 205 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4247  LexA repressor  72.33 
 
 		 207 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  72.82 
 
 		 207 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  71.57 
 
 		 205 aa  300  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  70.24 
 
 		 206 aa  298  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04014  LexA repressor  70.05 
 
 		 208 aa  298  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0108  SOS-response transcriptional repressor, LexA  69.71 
 
 		 209 aa  295  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  70.24 
 
 		 206 aa  293  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00268  LexA repressor  74.15 
 
 		 206 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  68.47 
 
 		 211 aa  289  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002149  SOS-response repressor and protease LexA  72.82 
 
 		 207 aa  289  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  69.12 
 
 		 205 aa  288  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2007  LexA repressor  70.71 
 
 		 202 aa  284  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.417718  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2893  LexA repressor  71.36 
 
 		 207 aa  278  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3862  LexA repressor  70.73 
 
 		 206 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4603  LexA repressor  69.76 
 
 		 206 aa  275  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3789  LexA repressor  70.24 
 
 		 206 aa  275  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0260  LexA repressor  70.44 
 
 		 204 aa  274  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3989  LexA repressor  69.76 
 
 		 206 aa  273  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3780  LexA repressor  69.76 
 
 		 206 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4178  LexA repressor  69.76 
 
 		 206 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0156  LexA repressor  69.76 
 
 		 206 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4309  LexA repressor  69.76 
 
 		 206 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4110  LexA repressor  69.76 
 
 		 206 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1787  LexA repressor  68.5 
 
 		 201 aa  267  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.916871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  65.02 
 
 		 204 aa  265  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  64.68 
 
 		 202 aa  261  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1683  LexA repressor  64.68 
 
 		 202 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141699  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  64.68 
 
 		 202 aa  260  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  64.68 
 
 		 202 aa  260  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  64.68 
 
 		 202 aa  259  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  64.18 
 
 		 202 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  65.02 
 
 		 204 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  64.53 
 
 		 204 aa  259  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1483  SOS-response transcriptional repressor, LexA  64.32 
 
 		 261 aa  254  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  63.68 
 
 		 202 aa  254  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2117  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60.29 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  hitchhiker  0.000000326173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  60.7 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1096  SOS-response transcriptional repressor, LexA  62.81 
 
 		 208 aa  251  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0403674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  59.43 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1179  LexA repressor  58.96 
 
 		 216 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865174  normal  0.239395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1981  LexA repressor  57.34 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0274768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1240  LexA repressor  58.41 
 
 		 216 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0593225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2471  LexA repressor  56.48 
 
 		 216 aa  247  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.643159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1772  LexA repressor  56.02 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  59.18 
 
 		 202 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2070  SOS-response transcriptional repressor, LexA  62.37 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2008  LexA repressor  55.5 
 
 		 218 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2012  LexA repressor  56.28 
 
 		 235 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2481  LexA repressor  56.28 
 
 		 235 aa  241  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  56.28 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  56.28 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  56.28 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  56.28 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  56.28 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  56.28 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1918  LexA repressor  57.41 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1496  LexA repressor  55.81 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1516  LexA repressor  55.35 
 
 		 215 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4738  LexA repressor  55.35 
 
 		 215 aa  238  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483588  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1637  LexA repressor  54.88 
 
 		 215 aa  238  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1577  LexA repressor  55.35 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1120  LexA repressor  55.35 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1600  LexA repressor  55.35 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  54.17 
 
 		 216 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  56.94 
 
 		 224 aa  237  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1866  LexA repressor  56.48 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2636  LexA repressor  57.53 
 
 		 227 aa  235  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.270851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4912  LexA repressor  55.09 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  55.56 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2994  LexA repressor  56.48 
 
 		 224 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  56.85 
 
 		 201 aa  232  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2954  LexA repressor  55.56 
 
 		 234 aa  232  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2310  LexA repressor  55.56 
 
 		 224 aa  231  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.389414  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1549  LexA repressor  55.56 
 
 		 224 aa  231  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>