More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0501 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0501  transcriptional repressor, LexA family  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.862173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0518  SOS-response transcriptional repressor, LexA  87.64 
 
 		 258 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  43.39 
 
 		 202 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.61 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  34.71 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.2 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.17 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  35.29 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.75 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  32.92 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  32.92 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.75 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.75 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  30.29 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  33.19 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.44 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  34.66 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1179  LexA repressor  33.61 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865174  normal  0.239395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1240  LexA repressor  32.78 
 
 		 216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0593225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.84 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  33.33 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.52 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.25 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  35 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.17 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.38 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  33.2 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.56 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  33.2 
 
 		 216 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  32.26 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  29.17 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.14 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.83 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  32.79 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.97 
 
 		 200 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  30 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.89 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.02 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.4 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  31.44 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  32.13 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.4 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  31.25 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  31.73 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  33.47 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.88 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  30.67 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2117  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.29 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  hitchhiker  0.000000326173 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.93 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  32.08 
 
 		 204 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  31.12 
 
 		 202 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  32.23 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  33.33 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.98 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  30 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  32.23 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  32.02 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  31.12 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  32.39 
 
 		 233 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30 
 
 		 217 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  30.29 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  31.98 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  32.75 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  29.88 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  29.92 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  30.4 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.74 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1866  LexA repressor  32.23 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  30.8 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.71 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.13 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1483  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.29 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1475  LexA repressor  31.67 
 
 		 211 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.457406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  30.42 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  30 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2471  LexA repressor  31.12 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.643159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  32.24 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  29.46 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.08 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  30.71 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  29.46 
 
 		 201 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  32.1 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  29.46 
 
 		 204 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  30.83 
 
 		 233 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1071  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.13 
 
 		 218 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1772  LexA repressor  30.71 
 
 		 216 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  32.08 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  30.04 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1898  LexA repressor  30.53 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  30.45 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  31.39 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  28.51 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  28.1 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  31.39 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  31.72 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  31.39 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.05 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  29.88 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>