More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2105 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  64.29 
 
 		 132 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  59.38 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  57.81 
 
 		 202 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  54.84 
 
 		 139 aa  161  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  54.01 
 
 		 186 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  53.73 
 
 		 138 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  53.73 
 
 		 138 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  58.54 
 
 		 208 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  50.75 
 
 		 168 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  54.03 
 
 		 150 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  49.25 
 
 		 168 aa  154  9e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  51.18 
 
 		 168 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  54.26 
 
 		 143 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  57.26 
 
 		 150 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  57.6 
 
 		 206 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  55.22 
 
 		 153 aa  152  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  50.75 
 
 		 150 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  55.65 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  52.31 
 
 		 150 aa  148  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  50.36 
 
 		 147 aa  146  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  50.81 
 
 		 150 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  54.89 
 
 		 139 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  54.89 
 
 		 139 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  54.96 
 
 		 139 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  54.96 
 
 		 139 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  46.88 
 
 		 138 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  46.88 
 
 		 138 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  48.12 
 
 		 158 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.7 
 
 		 138 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  46.09 
 
 		 143 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  41.61 
 
 		 149 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  51.15 
 
 		 145 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  51.8 
 
 		 139 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  51.82 
 
 		 148 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  48.82 
 
 		 153 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  52.63 
 
 		 148 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  53.66 
 
 		 146 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  54.26 
 
 		 144 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  45.76 
 
 		 144 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  54.2 
 
 		 139 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  45.76 
 
 		 144 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  57.38 
 
 		 142 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  48.89 
 
 		 143 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.05 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  44.44 
 
 		 142 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  51.2 
 
 		 147 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  40.15 
 
 		 141 aa  125  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  48.8 
 
 		 164 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  50.85 
 
 		 143 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  48.89 
 
 		 139 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  48.89 
 
 		 139 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  48.89 
 
 		 139 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  46.21 
 
 		 139 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  46.21 
 
 		 139 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  46.21 
 
 		 139 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  46.21 
 
 		 139 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  46.21 
 
 		 139 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  46.21 
 
 		 139 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  46.21 
 
 		 139 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  46.21 
 
 		 139 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  45.45 
 
 		 139 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  52.54 
 
 		 143 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  47.1 
 
 		 142 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  45.74 
 
 		 163 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  50.86 
 
 		 146 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  46.61 
 
 		 145 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  32.77 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  51.13 
 
 		 140 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.77 
 
 		 243 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.19 
 
 		 228 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  45.45 
 
 		 137 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  44.85 
 
 		 145 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  38.64 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  47.86 
 
 		 143 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.2 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.78 
 
 		 149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.77 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  44.92 
 
 		 151 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  33.19 
 
 		 209 aa  109  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  32.76 
 
 		 204 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  43.57 
 
 		 154 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.19 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.36 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  31.76 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.77 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  34.55 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  34.27 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  34.27 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  34.27 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  34.27 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  34.27 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  32.24 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  43.44 
 
 		 151 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  34.32 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.87 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.96 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  35.51 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  31.78 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>