More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16001 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  100 
 
 
158 aa  319  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  70.63 
 
 
143 aa  206  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  73.13 
 
 
147 aa  204  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  67.91 
 
 
153 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  54.74 
 
 
144 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  54.74 
 
 
144 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  54.84 
 
 
202 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  52.24 
 
 
138 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  53.44 
 
 
138 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  53.12 
 
 
143 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  52.67 
 
 
138 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  48.15 
 
 
138 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  48.15 
 
 
138 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  54.4 
 
 
186 aa  141  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  48.12 
 
 
238 aa  140  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  50 
 
 
212 aa  134  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  51.13 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  51.54 
 
 
148 aa  131  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  50 
 
 
243 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  45.97 
 
 
150 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  46.77 
 
 
139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  46.83 
 
 
141 aa  127  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  52 
 
 
142 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  50 
 
 
153 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  41.6 
 
 
149 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  45.16 
 
 
150 aa  124  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  46.77 
 
 
150 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  44.7 
 
 
150 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.24 
 
 
132 aa  122  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  46.83 
 
 
206 aa  121  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  49.19 
 
 
144 aa  120  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  41.73 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  42.96 
 
 
208 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  42.34 
 
 
168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  47.97 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  43.2 
 
 
168 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  42.34 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  49.57 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  50 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  49.57 
 
 
143 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  45.83 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  43.08 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  42.31 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  42.31 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  42.31 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.36 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  44.36 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  44.36 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  42.31 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  46.83 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  42.31 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  42.31 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  48.31 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  42.31 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  44.36 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  42.31 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  45.69 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  48.18 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  45.99 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  46.56 
 
 
140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  38.1 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  45.38 
 
 
151 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  40.62 
 
 
163 aa  107  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  49.59 
 
 
139 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  42.76 
 
 
139 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  42.76 
 
 
139 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  42.64 
 
 
139 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  42.76 
 
 
139 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  45.3 
 
 
148 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  46.4 
 
 
145 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  44 
 
 
164 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  42.28 
 
 
150 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  40.48 
 
 
137 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  42.98 
 
 
145 aa  101  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  43.09 
 
 
151 aa  101  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  42.31 
 
 
171 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  38.71 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  36.15 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  39.02 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  37.4 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  40.16 
 
 
158 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  41.13 
 
 
142 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  41.73 
 
 
141 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.21 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  37.8 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.34 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.47 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  34.62 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  43.33 
 
 
171 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7045  peptidase S24 and S26 domain protein  43.08 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.8 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4982  SOS mutagenesis protein UmuD  37.82 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865075  unclonable  0.00000215009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  30.5 
 
 
141 aa  85.1  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  35.43 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  40.16 
 
 
135 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  40.16 
 
 
135 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.58 
 
 
135 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  42.28 
 
 
143 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1424  peptidase S24, S26A and S26B  40.65 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0735  peptidase S24, S26A and S26B  39.84 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>