More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0735 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0735  peptidase S24, S26A and S26B  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1424  peptidase S24, S26A and S26B  96.53 
 
 
144 aa  283  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  59.44 
 
 
158 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  58.04 
 
 
152 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  59.03 
 
 
143 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  56.74 
 
 
142 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0002  ultraviolet light resistance protein A  54.93 
 
 
141 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2121  RulA protein, putative  53.24 
 
 
147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1916  peptidase S24, S26A and S26B  53.24 
 
 
147 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  42.14 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  43.55 
 
 
153 aa  98.6  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  44.26 
 
 
186 aa  98.6  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  44.44 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  44.44 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  44.44 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  44.19 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.31 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  39.1 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  40 
 
 
163 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  39.84 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  42.15 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  42.15 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  39.84 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  35.56 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  39.29 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  39.06 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  40.8 
 
 
206 aa  91.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.35 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  39.67 
 
 
243 aa  87  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  40.94 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  41.8 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  39.84 
 
 
212 aa  83.6  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  36.17 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  41.35 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  39.68 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  35.94 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  38.89 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  38.89 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  38.89 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  38.89 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  38.89 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  38.89 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  38.89 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  38.89 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  37.5 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  34.33 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  39.84 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  40 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  36.43 
 
 
168 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  36.8 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  37.1 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  37.1 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.69 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.69 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  36.69 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  38.28 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  38.46 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  39.01 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  35.77 
 
 
202 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  38.1 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  38.1 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  36.69 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  33.82 
 
 
238 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.42 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  37.69 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  34.31 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.69 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  34.96 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  36.21 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.21 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  40.5 
 
 
135 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  39.23 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  31.06 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  37.5 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  36.69 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  37.96 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  34.88 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  35.43 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  33.6 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  33.57 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  33.86 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  38.32 
 
 
223 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  38.32 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  38.32 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  38.32 
 
 
223 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  35.34 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  38.32 
 
 
206 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  38.32 
 
 
206 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  38.32 
 
 
206 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  36.36 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  38.32 
 
 
206 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  34.88 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  38.83 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  38.32 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  38.32 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  29.6 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  33.85 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  37.29 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.88 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>