More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0275 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  100 
 
 
144 aa  290  6e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  100 
 
 
144 aa  290  6e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  54.74 
 
 
158 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  61.48 
 
 
153 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  60.33 
 
 
138 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  59.5 
 
 
138 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  53.03 
 
 
147 aa  157  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  59.5 
 
 
138 aa  155  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  55.93 
 
 
143 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  57.85 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  50.85 
 
 
186 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  41.46 
 
 
202 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  47.79 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  45.76 
 
 
238 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  40.58 
 
 
208 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  50.42 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  50.42 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  50.85 
 
 
243 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  48.31 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  42.97 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  52.14 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  47.01 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  43.9 
 
 
147 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  48.31 
 
 
206 aa  122  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  41.32 
 
 
151 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  45.04 
 
 
141 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  46.46 
 
 
143 aa  121  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  49.22 
 
 
149 aa  121  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  46.46 
 
 
143 aa  120  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  43.65 
 
 
151 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  47.54 
 
 
151 aa  120  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  46.22 
 
 
137 aa  120  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  46.61 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  42.74 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  44.92 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.07 
 
 
132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  42.06 
 
 
171 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  45.67 
 
 
143 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  39.83 
 
 
154 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  43.7 
 
 
150 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  48.31 
 
 
168 aa  115  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  48.31 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  44.92 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  48.31 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.12 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  37.6 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  44.17 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  46.28 
 
 
149 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  42.31 
 
 
150 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  42.52 
 
 
164 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  48.28 
 
 
146 aa  110  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  43.86 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  45.24 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  42.31 
 
 
139 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  43.59 
 
 
163 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  45.38 
 
 
142 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.03 
 
 
150 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7045  peptidase S24 and S26 domain protein  44.44 
 
 
151 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  37.9 
 
 
142 aa  103  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  40.87 
 
 
148 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  45 
 
 
144 aa  103  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  53.57 
 
 
139 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  53.57 
 
 
139 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  53.57 
 
 
139 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  53.57 
 
 
139 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  40.3 
 
 
145 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  41.74 
 
 
142 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  40.34 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  39.5 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  39.5 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  39.5 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  39.5 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  39.5 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  39.5 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  39.5 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  39.5 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  39.53 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  53.85 
 
 
139 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  53.85 
 
 
139 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  53.85 
 
 
139 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  54.43 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  48.72 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  35.83 
 
 
158 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  39.5 
 
 
137 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4982  SOS mutagenesis protein UmuD  38.79 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865075  unclonable  0.00000215009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.83 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.03 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  38.52 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1833  putative prophage repressor  38.26 
 
 
274 aa  84.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  35.71 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  37.29 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1782  putative prophage repressor  35.65 
 
 
274 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2195  putative prophage repressor  35.65 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.543722  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.19 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  41.59 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  37.17 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  38.05 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  37.17 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2596  putative prophage repressor  35.29 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.82 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>