More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3236 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  100 
 
 		 135 aa  277  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  82.44 
 
 		 141 aa  229  8.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  80.74 
 
 		 135 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  80.74 
 
 		 135 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  79.26 
 
 		 135 aa  225  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  81.06 
 
 		 137 aa  224  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  76.87 
 
 		 135 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  78.95 
 
 		 134 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  72.39 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  72.73 
 
 		 142 aa  203  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  69.7 
 
 		 135 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  69.85 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  70.15 
 
 		 135 aa  192  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  66.92 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1833  putative prophage repressor  65.32 
 
 		 274 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1782  putative prophage repressor  62.9 
 
 		 274 aa  168  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2195  putative prophage repressor  62.9 
 
 		 274 aa  168  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.543722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1635  umuD protein  59.85 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  52.99 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2345  putative prophage repressor  59.84 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3452  umuD protein  84.38 
 
 		 73 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000303705  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  42.86 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  46.02 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4173  putative prophage repressor  51.43 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  42.86 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  42.86 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  42.61 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  42.61 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  42.61 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  42.61 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  42.86 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  42.61 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  42.61 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  42.61 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  42.61 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  42.61 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  42.86 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  37.5 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  37.82 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  36.29 
 
 		 206 aa  92  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  41.59 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  41.59 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  40.16 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  41.59 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  43.64 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  42.62 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1988  hypothetical protein  51.61 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12249  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  35.71 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  39.5 
 
 		 150 aa  86.7  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  34.92 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4594  SOS-response transcriptional repressor LexA-like protein  56.34 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235187  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1876  hypothetical protein  51.61 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13872  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  39.13 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  38.94 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  35.71 
 
 		 212 aa  84  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  35.2 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  36.22 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.53 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  39.5 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  39.5 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  37.29 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  39.17 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  37.29 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  32.28 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  39.82 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  41.67 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  36.07 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.64 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.64 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  38.66 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.64 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  38.46 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.14 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.07 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  34.21 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  41.28 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  35.2 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  34.85 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  38.66 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  40 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.8 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  35.2 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.2 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  35.11 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.33 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  35.59 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  34.68 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  34.68 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  34.13 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.59 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.25 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  31.97 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  37.17 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  37.93 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.61 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.68 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  32.28 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1424  peptidase S24, S26A and S26B  37.19 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0735  peptidase S24, S26A and S26B  36.36 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1781  putative prophage repressor  36.52 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000051926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>