121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4594 on replicon NC_009999
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009999  Sbal195_4594  SOS-response transcriptional repressor LexA-like protein  100 
 
 
75 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235187  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  94.67 
 
 
144 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  66.2 
 
 
142 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  63.38 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  60.56 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  60.56 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  60.56 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  56.94 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  56.34 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  57.75 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  54.93 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  54.05 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  56.34 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  56.34 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  57.14 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  52.11 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  56.25 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  54.69 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1833  putative prophage repressor  63.79 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1782  putative prophage repressor  62.07 
 
 
274 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2195  putative prophage repressor  62.07 
 
 
274 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.543722  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  53.12 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  51.72 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1876  hypothetical protein  52.17 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  51.56 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1981  SOS-response transcriptional repressors (RecA- mediated autopeptidase)-like protein  50 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125768  normal  0.0169516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  56.6 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  46.15 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4173  putative prophage repressor  46.05 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0524637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  53.97 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  46.88 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1988  hypothetical protein  52.17 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12249  normal  0.394206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  58.49 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  58.49 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1635  umuD protein  54.93 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  58.49 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  58.49 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  58.49 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  58.49 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  58.49 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  54.24 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  58.49 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  58.49 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  48.65 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  48.65 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  53.7 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  53.7 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  50 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  50.79 
 
 
238 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  47.46 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  53.97 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  53.97 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  53.97 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  46.88 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  50 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  50 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  50 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  50 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  50 
 
 
202 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  48.44 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  50 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  41.79 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.56 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  46.88 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  51.79 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  51.67 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  51.72 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2345  putative prophage repressor  56.06 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  46.15 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  50 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  52.63 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  46.88 
 
 
208 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  50 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  46.88 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  47.46 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  45 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  51.85 
 
 
243 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  48.15 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  53.7 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  46.3 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  49.15 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  40.62 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  42.19 
 
 
206 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.24 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  46.3 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.24 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  47.46 
 
 
168 aa  57.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  50 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  47.46 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  47.46 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  50 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  50 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  42.11 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.44 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  48.15 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  46.3 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  42.19 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  44.44 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  42.19 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  48.15 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>