211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2345 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2345  putative prophage repressor  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  61.72 
 
 		 134 aa  164  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  62.2 
 
 		 135 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  62.2 
 
 		 135 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  60.16 
 
 		 141 aa  159  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  59.84 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  62.2 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  60.63 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  60.63 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  57.81 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  61.42 
 
 		 135 aa  155  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  59.84 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  56.39 
 
 		 135 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  59.84 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  54.69 
 
 		 142 aa  146  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1635  umuD protein  55.12 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1833  putative prophage repressor  55.28 
 
 		 274 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1782  putative prophage repressor  52.85 
 
 		 274 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2195  putative prophage repressor  52.85 
 
 		 274 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.543722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.96 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  43.52 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  40.98 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  38.89 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.35 
 
 		 158 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  38.93 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  40.48 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  36.51 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  39.37 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  40.65 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  40.65 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4173  putative prophage repressor  38.58 
 
 		 244 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524637 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  35.71 
 
 		 212 aa  87  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  38.58 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.4 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  36.52 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  42.15 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  42.15 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  42.15 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  42.73 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  39.67 
 
 		 202 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.07 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  41.07 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  40.71 
 
 		 186 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  41.07 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  41.07 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  40 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  36.96 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.65 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  37.4 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  36.07 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  40 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  40 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  40 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  40 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  40 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  40 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  40.71 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  37.7 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  33.86 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  40 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  39.68 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  37.1 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4594  SOS-response transcriptional repressor LexA-like protein  56.06 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235187  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  40 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  35.48 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  41.59 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1988  hypothetical protein  53.09 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12249  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  37.5 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.22 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1876  hypothetical protein  53.09 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13872  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  36.51 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.1 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  37.29 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  35.09 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  36.52 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  36.51 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.4 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  35.83 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  37.5 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  38.6 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  37.5 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  37.5 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.6 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6846  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  37.5 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.391579  normal  0.145831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  39.45 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  38.4 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.33 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  36.28 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1424  peptidase S24, S26A and S26B  37.61 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  35.2 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  33.33 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  35.29 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  32.52 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  32.79 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.2 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0735  peptidase S24, S26A and S26B  36.21 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  34.4 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  31.71 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  36.36 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>