237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1833 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1833  putative prophage repressor  100 
 
 
274 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2195  putative prophage repressor  89.42 
 
 
274 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.543722  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1782  putative prophage repressor  89.05 
 
 
274 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  65.65 
 
 
142 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  65.32 
 
 
135 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  61.29 
 
 
134 aa  169  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  66.13 
 
 
135 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  66.13 
 
 
135 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  62.1 
 
 
135 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  58.87 
 
 
141 aa  162  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  63.71 
 
 
135 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  60.48 
 
 
137 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  58.06 
 
 
142 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  60.48 
 
 
135 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4173  putative prophage repressor  39.26 
 
 
244 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0524637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  55.65 
 
 
135 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  54.84 
 
 
141 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  53.23 
 
 
137 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  51.3 
 
 
144 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2345  putative prophage repressor  55.28 
 
 
134 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1635  umuD protein  48.82 
 
 
137 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  41.74 
 
 
147 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  36 
 
 
206 aa  88.6  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  38.26 
 
 
144 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1988  hypothetical protein  56.58 
 
 
91 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12249  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.26 
 
 
144 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  41.12 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  41.12 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  41.12 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  41.12 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  41.12 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  41.12 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  41.12 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  41.12 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  41.12 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1876  hypothetical protein  56.58 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13872  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  40.37 
 
 
186 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  39.22 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  39.22 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  39.22 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  35.96 
 
 
139 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  35.96 
 
 
139 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.96 
 
 
139 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  36.36 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  35.96 
 
 
139 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  35 
 
 
144 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  32.86 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  37.39 
 
 
153 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  36.11 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  32.59 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  31.78 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  29.61 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  38.83 
 
 
150 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  33.91 
 
 
148 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  38.83 
 
 
208 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  36.7 
 
 
148 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4594  SOS-response transcriptional repressor LexA-like protein  63.79 
 
 
75 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235187  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  38.02 
 
 
150 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  40.91 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  34.92 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  33.04 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  35.59 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  35.65 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  35.65 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  35.65 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  38.32 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  37.61 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  37.93 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.91 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  32.74 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.58 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3452  umuD protein  50.68 
 
 
73 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000303705  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  32.77 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  33.07 
 
 
138 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  33.07 
 
 
138 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  31.2 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.93 
 
 
151 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  37.07 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  35.92 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  33.62 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  32.77 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  38.46 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  38.05 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  39.45 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  35.19 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.78 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.03 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1781  putative prophage repressor  33.33 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000051926  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  31.4 
 
 
163 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  32.17 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  33.64 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.58 
 
 
138 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  32.71 
 
 
145 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  37.86 
 
 
212 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  32.84 
 
 
143 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  32.41 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  33.58 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.55 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  32.84 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0099  LexA repressor  33.98 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>